RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.62■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.62■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.62■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 SLC24A1O60721 1099 aa30.61■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.6■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.6■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 AKAP12Q02952 1782 aa30.6■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.6■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.6■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.6■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
NME4-201ENST00000219479 RGPD5Q99666 1765 aa30.57■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 NBPF14Q5TI25 921 aa30.57■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 USP47Q96K76 1375 aa30.55■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 TESK2Q96S53 571 aa30.55■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.55■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.54■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.54■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.53■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.53■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 SOX12O15370 315 aa30.52■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.52■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.51■■■□□ 2.48
NME4-201ENST00000219479 DDB1Q16531 1140 aa30.51■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 TMF1P82094 1093 aa30.48■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.48■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 NFAT5O94916 1531 aa30.47■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.47■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF25Q86VW2 580 aa30.47■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.45■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 A0A1W2PP64 1363 aa30.45■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 PLSCR1O15162 318 aa30.45■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 PTF1AQ7RTS3 328 aa30.45■■■□□ 2.47
NME4-201ENST00000219479 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 CASZ1Q86V15 1759 aa30.44■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 NME9Q86XW9 330 aa30.44■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 BCL9O00512 1426 aa30.43■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 SPON1Q9HCB6 807 aa30.43■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 KCNQ2O43526 872 aa30.42■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 CDCA8Q53HL2 280 aa30.41■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 ABCC6O95255 1503 aa30.41■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.4■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 USP31Q70CQ4 1352 aa30.4■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
NME4-201ENST00000219479 USP54Q70EL1 1684 aa30.39■■■□□ 2.45
NME4-201ENST00000219479 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.38■■■□□ 2.45
NME4-201ENST00000219479 PROM2Q8N271 834 aa30.35■■■□□ 2.45
NME4-201ENST00000219479 CCDC7Q96M83 1385 aa30.34■■■□□ 2.45
NME4-201ENST00000219479 LTN1O94822 1766 aa30.33■■■□□ 2.45
NME4-201ENST00000219479 TNS2Q63HR2 1409 aa30.33■■■□□ 2.45
NME4-201ENST00000219479 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.32■■■□□ 2.44
NME4-201ENST00000219479 NHSQ6T4R5 1651 aa30.3■■■□□ 2.44
NME4-201ENST00000219479 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
NME4-201ENST00000219479 EXOC5O00471 708 aa30.29■■■□□ 2.44
NME4-201ENST00000219479 YY1P25490 414 aa30.29■■■□□ 2.44
NME4-201ENST00000219479 COG3Q96JB2 828 aa30.29■■■□□ 2.44
NME4-201ENST00000219479 MYOM1P52179 1685 aa30.28■■■□□ 2.44
NME4-201ENST00000219479 TXNRD1Q16881 649 aa30.26■■■□□ 2.43
NME4-201ENST00000219479 ERBB3P21860 1342 aa30.24■■■□□ 2.43
NME4-201ENST00000219479 ZBTB7AO95365 584 aa30.23■■■□□ 2.43
NME4-201ENST00000219479 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
NME4-201ENST00000219479 STK32BQ9NY57 414 aa30.21■■■□□ 2.43
NME4-201ENST00000219479 BTAF1O14981 1849 aa30.2■■■□□ 2.43
NME4-201ENST00000219479 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.2■■■□□ 2.43
NME4-201ENST00000219479 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.2■■■□□ 2.43
NME4-201ENST00000219479 PAPPAQ13219 1627 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 DCAF8L1A6NGE4 600 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 PTGER2P43116 358 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 SLC15A2Q16348 729 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 KAT6BQ8WYB5 2073 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.17■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 ACSBG1Q96GR2 724 aa30.17■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.17■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 IL2RBP14784 551 aa30.16■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 FYB1O15117 783 aa30.15■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 AMPHP49418 695 aa30.14■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 IP6K1Q92551 441 aa30.14■■■□□ 2.42
NME4-201ENST00000219479 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
NME4-201ENST00000219479 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.12■■■□□ 2.41
NME4-201ENST00000219479 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
NME4-201ENST00000219479 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.11■■■□□ 2.41
NME4-201ENST00000219479 MTFR1LQ9H019 292 aa30.09■■■□□ 2.41
NME4-201ENST00000219479 FBLN1P23142 703 aa30.08■■■□□ 2.41
NME4-201ENST00000219479 SGIP1Q9BQI5 828 aa30.08■■■□□ 2.41
NME4-201ENST00000219479 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.08■■■□□ 2.41
NME4-201ENST00000219479 HOXC9P31274 260 aa30.07■■■□□ 2.4
NME4-201ENST00000219479 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
NME4-201ENST00000219479 UTRNP46939 3433 aa30.06■■■□□ 2.4
NME4-201ENST00000219479 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms