RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF15Q9UIH9 416 aa26.51■■□□□ 1.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AQP9O43315 295 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP20O60882 483 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM7SF2O76062 418 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GP1BAP07359 652 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMP2P16035 220 aa26.5■■□□□ 1.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THOP1P52888 689 aa26.5■■□□□ 1.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INSIG1O15503 277 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XPAP23025 273 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAMLD1Q13495 774 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTK2BQ14289 1009 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYTH1Q15438 398 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMX1AQ8TE12 382 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTN2A2Q8WVV5 523 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOC2Q96KP1 924 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP4E1Q9UPM8 1137 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 U3KQA8 63 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRINP1O60477 761 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITIH2P19823 946 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMA2P25787 234 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUOXP51687 545 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDST2P52849 883 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YPEL5P62699 121 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDCP2Q5VXM1 449 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAAF5Q86Y56 855 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCG4Q9H172 646 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC19Q9H756 370 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa26.48■■□□□ 1.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELP6Q0PNE2 266 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa26.47■■□□□ 1.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCAR2Q8TDS4 363 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRELD1Q96HD1 420 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEPDC7Q96QD5 511 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL12RB2Q99665 862 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDFQ9HBH1 243 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPASTQ9UBP0 616 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC400499M0QZD8 3231 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC53A6NM62 1247 aa26.46■■□□□ 1.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 J3KR12 359 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGNO95427 931 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITPKBP27987 946 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTN2P35609 894 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRM3Q14832 879 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASIC2Q16515 512 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB133Q30KQ1 61 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM52BQ4KMG9 183 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBFAQ8N0V3 343 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK15Q8TD08 544 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF11Q92914 225 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUV39H2Q9H5I1 410 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SALL4Q9UJQ4 1053 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOR1BO14657 336 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPP1O14773 563 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF11O60813 436 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKN3Q16667 212 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CA9Q16790 459 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERMARDQ5T6L9 678 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHACTR4Q8IZ21 702 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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