RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ZNF235Q14590 738 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ODF2Q5BJF6 829 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NPNTQ6UXI9 565 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TTC7BQ86TV6 843 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HORMAD1Q86X24 394 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RFX6Q8HWS3 928 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MAML1Q92585 1016 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 KLK6Q92876 244 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 FATE1Q969F0 183 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RAB7BQ96AH8 199 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HDAC11Q96DB2 347 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SERAC1Q96JX3 654 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MGME1Q9BQP7 344 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 DCHS1Q96JQ0 3298 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PR77 199 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.131e-16■■■□□ 16.5
ACTB-206ENST00000443528 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MX2P20592 715 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SDHBP21912 280 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MAXP61244 160 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 AP1S1P61966 158 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 DYNLT1P63172 113 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ADCY2Q08462 1091 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 FGL2Q14314 439 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 LLGL1Q15334 1064 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1524Q8TCG1 905 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 FEM1CQ96JP0 617 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 LGMNQ99538 433 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RTKNQ9BST9 563 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NOD2Q9HC29 1040 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NT5MQ9NPB1 228 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 DMTF1Q9Y222 760 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PLXNA2O75051 1894 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 VILLO15195 856 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SLC31A1O15431 190 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP6O43182 974 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TSPAN6O43657 245 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PRLRP16471 622 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CTNNA2P26232 953 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CD38P28907 300 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SERPINA4P29622 427 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NUDT1P36639 197 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PI4KAP42356 2102 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PEX5P50542 639 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 BCL2L1Q07817 233 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.136e-11■■■■□ 19.6
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ACTB-206ENST00000443528 UGP2Q16851 508 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 KIF19Q2TAC6 998 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 KAZNQ674X7 775 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 BBS5Q8N3I7 341 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CCNYQ8ND76 341 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 EXD1Q8NHP7 514 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 OLFM3Q96PB7 478 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CA5BQ9Y2D0 317 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 IGLON5A6NGN9 336 aa15.86■□□□□ 0.13
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