RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554062.5

PABPN1-204, Transcript of poly(A) binding protein nuclear 1, human

TSL 3

Gene PABPN1, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPN1-204	ENST00000554062		A8MZ25	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	PAGE4	O60829	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	TACC1	O75410	805 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	NDUFS3	O75489	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	DNTT	P04053	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	TFEB	P19484	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	HOXA5	P20719	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	IL11	P20809	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MAPK4	P31152	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	TTK	P33981	857 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	CDH8	P55286	799 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	CYP4F2	P78329	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	TFAP4	Q01664	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	RHAG	Q02094	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	GALNT3	Q14435	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	BECN1	Q14457	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	NTRK2	Q16620	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062		Q6YL49	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062		Q9N2J8	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	CUX1	P39880	1505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	BEST1	O76090	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	CBX6	O95503	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	APOA4	P06727	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	FCGR2A	P12318	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	ZNF20	P17024	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	TMEM11	P17152	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	CDA	P32320	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MPL	P40238	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	FOXE3	Q13461	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	OLIG2	Q13516	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	MED22	Q15528	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPN1-204	ENST00000554062	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	DDAH2	O95865	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	RB1	P06400	928 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	HEXA	P06865	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	CD63	P08962	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	SLC2A4	P14672	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PABPN1-204	ENST00000554062	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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