RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 TMX2Q9Y320 296 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 A0A087WXM4 84 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 CFAP99D6REC4 459 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 MICAL2O94851 1124 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 EGFRP00533 1210 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 C2P06681 752 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ZNF12P17014 697 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 GALNT2Q10471 571 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 TRIM16LQ309B1 348 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.06□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 LSMEM2Q8N112 164 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 PARP8Q8N3A8 854 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 C12orf29Q8N999 325 aa8.06□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 TPK1Q9H3S4 243 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 CDH7Q9ULB5 785 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.06□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 SLX4Q8IY92 1834 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 SOBPA7XYQ1 873 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ATP6AP2O75787 350 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 CYP2F1P24903 491 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 OXTRP30559 389 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 OPRL1P41146 370 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 TFDP2Q14188 446 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 EMC2Q15006 297 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 BCL2A1Q16548 175 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 STARD8Q92502 1023 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 MFSD3Q96ES6 412 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 CNDP1Q96KN2 507 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 TASP1Q9H6P5 420 aa8.05□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 HM13Q8TCT9 377 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 RTP4Q96DX8 246 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.05□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 MGAMO43451 1857 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 A0A1W2PQ67 120 aa8.05□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 YDJCA8MPS7 323 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 KCNA2P16389 499 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 TSPAN8P19075 237 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 GPD1P21695 349 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 CNTN2Q02246 1040 aa8.05□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 MAPK11Q15759 364 aa8.05□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.05□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.05□□□□□ -1.12
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TPM3-215ENST00000469717 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 LRRC39Q96DD0 335 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 HESX1Q9UBX0 185 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.05□□□□□ -1.12
TPM3-215ENST00000469717 CDYLQ9Y232 598 aa8.05□□□□□ -1.12
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