RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 TMC6Q7Z403 805 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAAF5Q86Y56 855 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 NAXDQ8IW45 347 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CHST14Q8NCH0 376 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TMIEQ8NEW7 156 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGEH1Q9H213 219 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM4CQ9H3R0 1056 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PARVAQ9NVD7 372 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FZD10Q9ULW2 581 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TRPM6Q9BX84 2022 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ACACBO00763 2458 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.323e-23■□□□□ 8.8
SH3BP4-211ENST00000493436 CREB3O43889 395 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 FTLP02792 175 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PRNPP04156 253 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 GZMAP12544 262 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 SKILP12757 684 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 EPHB2P29323 1055 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 DNA2P51530 1060 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 C21orf59P57076 290 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM193AP78312 1265 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 SHC2P98077 582 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 FOXC1Q12948 553 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ARRDC3Q96B67 414 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 SERAC1Q96JX3 654 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP44Q9C0F1 390 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 DYRK4Q9NR20 520 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 IL36AQ9UHA7 158 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 HPCAL4Q9UM19 191 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ACTL7AQ9Y615 435 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNK3O14649 394 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 VILLO15195 856 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 LATO43561 262 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 RAMP2O60895 175 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PSMA2P25787 234 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CD38P28907 300 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PBX1P40424 430 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CTSKP43235 329 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 AIF1P55008 147 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC15Q0P6D6 951 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ARSIQ5FYB1 569 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 SKA1Q96BD8 255 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 EPAS1Q99814 870 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PQJ5 194 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF103O00237 685 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 WNT9AO14904 365 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 LEFTY1O75610 366 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CD160O95971 181 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 WNT1P04628 370 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 TAS2R38P59533 333 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CARD16Q5EG05 197 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM69Q86WT6 500 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF354CQ86Y25 554 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF653Q96CK0 615 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 HEPHQ9BQS7 1158 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 TM6SF2Q9BZW4 377 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PREBQ9HCU5 417 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 WASF2Q9Y6W5 498 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PR77 199 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM191CA6NGB0 347 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 H0Y8X5 98 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF423Q2M1K9 1284 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC45A4Q5BKX6 768 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CPLX3Q8WVH0 158 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM11Q96F44 468 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.1 ms