RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 DONSONQ9NYP3 566 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 IMPACTQ9P2X3 320 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 TFR2Q9UP52 801 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 THADAQ6YHU6 1953 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 BUB1O43683 1085 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 NDUFA10O95299 355 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CD48P09326 243 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 AMPD1P23109 780 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 CHRNA3P32297 505 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 GJC1P36383 396 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 ARL4AP40617 200 aa16.02■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.02■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 ZNF354CQ86Y25 554 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.02■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 PILRBQ9UKJ0 227 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-206ENST00000443528 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.02■□□□□ 0.16
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ACTB-206ENST00000443528 J3KR12 359 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 MMRN1Q13201 1228 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 POM121L1PQ3SYA9 428 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 SYT12Q8IV01 421 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 PRAMEF11O60813 436 aa16■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 SEMA4FO95754 770 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 MAOBP27338 520 aa16■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 DNA2P51530 1060 aa16■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 ARSIQ5FYB1 569 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 FAM46CQ5VWP2 391 aa16■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 LZTR1Q8N653 840 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 DNASE2BQ8WZ79 361 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 RXFP3Q9NSD7 469 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 KLHL11Q9NVR0 708 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 IL36AQ9UHA7 158 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 DFFAO00273 331 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 GDF9O60383 454 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 LEFTY1O75610 366 aa15.99■□□□□ 0.15
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