RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM5Q9C035 493 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMX1Q9H3N1 280 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOB4Q9Y3A3 225 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 NID2Q14112 1375 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0G2JPF8 293 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa-0.56□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM178BH3BS89 294 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPC1O15118 1278 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3-13P01766 116 aa-0.56□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 FTH1P19P0C7X4 201 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOLR2P14207 255 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP6V1B1P15313 513 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUSP1P28562 367 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 FMO4P31512 558 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 AVPR1AP37288 418 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR3P46089 330 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT17Q04695 432 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF79Q15937 498 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC27A1Q6PCB7 646 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYB5R4Q7L1T6 521 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIGA2Q7L4E1 593 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF152Q8N8N0 203 aa-0.56□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB12Q8WXK4 309 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASL10AQ92737 203 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUS1Q96E22 293 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF583Q96ND8 569 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSTL1Q9H114 145 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 TUBD1Q9UJT1 453 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2CD2Q9Y426 696 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPED1A4D0V7 1026 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM227AF5H4B4 570 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDH1P12830 882 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 HGFP14210 728 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLRC1P26715 233 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACVR2AP27037 513 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTR7P34969 479 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP2K2P36507 400 aa-0.57□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 UCP3P55916 312 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL2P60568 153 aa-0.57□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTAPQ13126 283 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEMA3BQ13214 749 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 TUBB8Q3ZCM7 444 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR38Q5JTN6 314 aa-0.57□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SCML4Q8N228 414 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPA6Q8N4T0 437 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRSS33Q8NF86 280 aa-0.57□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TM9SF4Q92544 642 aa-0.57□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.57□□□□□ -2.5
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SORL1Q92673 2214 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GVM2 712 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIMM23O14925 209 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 MID1O15344 667 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITM2AO43736 263 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CH25HO95992 272 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITGA2BP08514 1039 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 GP9P14770 177 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC16A2P36021 539 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTHFRP42898 656 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC11A2P49281 568 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGTR2P50052 363 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMPRSS3P57727 454 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX16P57768 344 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 RELQ04864 619 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFAIP1Q13829 316 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMOTQ4VCS5 1084 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLA1AQ53H76 456 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2CD6Q53TS8 623 aa-0.58□□□□□ -2.5
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