RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630868.1

CDRT1-208, CMT1A duplicated region transcript 1, human

BASIC

Gene CDRT1, Length 794 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDRT1-208	ENST00000630868	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CIAO1	O76071	339 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	LARGE1	O95461	756 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	HSPA4L	O95757	839 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	UBL4A	P11441	157 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CYP2B6	P20813	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	HMGCS2	P54868	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	PIGF	Q07326	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	SPP2	Q13103	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	RIN1	Q13671	783 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	NFYC	Q13952	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	RASA2	Q15283	850 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	PERP	Q96FX8	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	RLF	Q13129	1914 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	VILL	O15195	856 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	APOA4	P06727	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	GLI1	P08151	1106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	HOXC6	P09630	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	PEPD	P12955	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ACP5	P13686	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ADORA2A	P29274	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CD6	P30203	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	UQCRC1	P31930	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	BTD	P43251	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CHN2	P52757	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	BACE1	P56817	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	SATB1	Q01826	763 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	P3H1	Q32P28	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	DOK3	Q7L591	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	NEU1	Q99519	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDRT1-208	ENST00000630868	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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