Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN8

CLEC9A, C-type lectin domain family 9 member A, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC9AQ6UXN8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLEC9AQ6UXN8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLEC9AQ6UXN8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLEC9AQ6UXN8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLEC9AQ6UXN8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLEC9AQ6UXN8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC9AQ6UXN8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC9AQ6UXN8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLEC9AQ6UXN8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC9AQ6UXN8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC9AQ6UXN8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLEC9AQ6UXN8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLEC9AQ6UXN8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLEC9AQ6UXN8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC9AQ6UXN8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC9AQ6UXN8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLEC9AQ6UXN8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLEC9AQ6UXN8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLEC9AQ6UXN8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLEC9AQ6UXN8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC9AQ6UXN8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC9AQ6UXN8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLEC9AQ6UXN8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLEC9AQ6UXN8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLEC9AQ6UXN8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLEC9AQ6UXN8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLEC9AQ6UXN8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLEC9AQ6UXN8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLEC9AQ6UXN8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLEC9AQ6UXN8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLEC9AQ6UXN8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLEC9AQ6UXN8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLEC9AQ6UXN8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLEC9AQ6UXN8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLEC9AQ6UXN8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLEC9AQ6UXN8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLEC9AQ6UXN8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLEC9AQ6UXN8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLEC9AQ6UXN8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLEC9AQ6UXN8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLEC9AQ6UXN8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLEC9AQ6UXN8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLEC9AQ6UXN8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLEC9AQ6UXN8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC9AQ6UXN8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC9AQ6UXN8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC9AQ6UXN8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLEC9AQ6UXN8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLEC9AQ6UXN8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLEC9AQ6UXN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC9AQ6UXN8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC9AQ6UXN8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLEC9AQ6UXN8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLEC9AQ6UXN8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLEC9AQ6UXN8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLEC9AQ6UXN8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLEC9AQ6UXN8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLEC9AQ6UXN8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLEC9AQ6UXN8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLEC9AQ6UXN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLEC9AQ6UXN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLEC9AQ6UXN8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLEC9AQ6UXN8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLEC9AQ6UXN8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLEC9AQ6UXN8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC9AQ6UXN8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC9AQ6UXN8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC9AQ6UXN8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC9AQ6UXN8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC9AQ6UXN8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC9AQ6UXN8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC9AQ6UXN8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC9AQ6UXN8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC9AQ6UXN8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC9AQ6UXN8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC9AQ6UXN8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC9AQ6UXN8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC9AQ6UXN8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLEC9AQ6UXN8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC9AQ6UXN8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC9AQ6UXN8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC9AQ6UXN8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC9AQ6UXN8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC9AQ6UXN8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC9AQ6UXN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLEC9AQ6UXN8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLEC9AQ6UXN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLEC9AQ6UXN8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC9AQ6UXN8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC9AQ6UXN8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC9AQ6UXN8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC9AQ6UXN8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLEC9AQ6UXN8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC9AQ6UXN8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLEC9AQ6UXN8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLEC9AQ6UXN8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLEC9AQ6UXN8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC9AQ6UXN8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC9AQ6UXN8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC9AQ6UXN8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms