RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SSH2Q76I76 1423 aa26.98■■□□□ 1.91
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.94■■□□□ 1.9
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.88■■□□□ 1.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PIK3C2AO00443 1686 aa26.88■■□□□ 1.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLEKHG5O94827 1062 aa26.88■■□□□ 1.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.88■■□□□ 1.89
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARHGEF10O15013 1369 aa26.85■■□□□ 1.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FYB1O15117 783 aa26.84■■□□□ 1.89
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.82■■□□□ 1.88
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NLRP13Q86W25 1043 aa26.8■■□□□ 1.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP31Q70CQ4 1352 aa26.78■■□□□ 1.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.77■■□□□ 1.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.77■■□□□ 1.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.76■■□□□ 1.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COG3Q96JB2 828 aa26.76■■□□□ 1.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP54Q70EL1 1684 aa26.75■■□□□ 1.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCA3Q99758 1704 aa26.74■■□□□ 1.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SOX12O15370 315 aa26.74■■□□□ 1.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.7■■□□□ 1.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FBLN1P23142 703 aa26.69■■□□□ 1.86
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 MORC1Q86VD1 984 aa26.67■■□□□ 1.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRP6O75581 1613 aa26.66■■□□□ 1.86
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADAMTS2O95450 1211 aa26.65■■□□□ 1.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NFAT5O94916 1531 aa26.65■■□□□ 1.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIAA0232Q92628 1395 aa26.61■■□□□ 1.85
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHRNA2Q15822 529 aa26.58■■□□□ 1.85
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.58■■□□□ 1.85
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM83GA6ND36 823 aa26.58■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CPDO75976 1380 aa26.57■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.57■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.57■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.56■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.56■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.55■■□□□ 1.84
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 POLKQ9UBT6 870 aa26.54■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL18A1P39060 1754 aa26.51■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PEAK1Q9H792 1746 aa26.51■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AMPHP49418 695 aa26.51■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RALBP1Q15311 655 aa26.51■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NGLY1Q96IV0 654 aa26.51■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.51■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RGPD5Q99666 1765 aa26.5■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PPP2R1AP30153 589 aa26.49■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.48■■□□□ 1.83
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.48■■□□□ 1.83
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