RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYOM1P52179 1685 aa46.04■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP46.04■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 LMOD2Q6P5Q4 547 aa46.02■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSH2Q76I76 1423 aa46.01■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PP64 1363 aa46.01■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR3GLQ9BT43 218 aa46■■■■■ 4.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRKQ7Z2Y5 1582 aa45.99■■■■■ 4.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa45.98■■■■■ 4.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF7Q2M1P5 1343 aa45.92■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa45.91■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABTB2Q8N961 1025 aa45.91■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRP6O75581 1613 aa45.9■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC21AQ8NDW8 1320 aa45.9■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3C2AO00443 1686 aa45.85■■■■■ 4.93
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCA3Q99758 1704 aa45.85■■■■■ 4.93
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa45.82■■■■■ 4.93
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUTM2GQ5VZR2 741 aa45.82■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC7Q96M83 1385 aa45.81■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP45.81■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 CABLES1Q8TDN4 633 aa45.81■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 NLRP13Q86W25 1043 aa45.8■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 WASHC2AQ641Q2 1341 aa45.79■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHG5O94827 1062 aa45.78■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP45.77■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 NLRP6P59044 892 aa45.77■■■■■ 4.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP19O94966 1318 aa45.74■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS2O95450 1211 aa45.73■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARD14Q9BXL6 1004 aa45.72■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 NME9Q86XW9 330 aa45.7■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP54Q70EL1 1684 aa45.69■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP31Q70CQ4 1352 aa45.69■■■■■ 4.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSD3Q9BZ95 1437 aa45.69■■■■■ 4.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 PANK3Q9H999 370 aa45.69■■■■■ 4.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLIT3O75094 1523 aa45.66■■■■■ 4.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf37Q96NL8 207 aa45.63■■■■■ 4.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZRANB1Q9UGI0 708 aa45.62■■■■■ 4.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF20BQ96Q89 1820 aa45.61■■■■■ 4.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCP02774 474 aa45.61■■■■■ 4.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa45.6■■■■■ 4.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 OVOS2Q6IE36 1432 aa45.6■■■■■ 4.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 FYB1O15117 783 aa45.58■■■■■ 4.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 NGLY1Q96IV0 654 aa45.57■■■■■ 4.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNH5Q8NCM2 988 aa45.57■■■■■ 4.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 CGNL1Q0VF96 1302 aa45.56■■■■■ 4.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 COG3Q96JB2 828 aa45.54■■■■■ 4.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0232Q92628 1395 aa45.52■■■■■ 4.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPDO75976 1380 aa45.52■■■■■ 4.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGNBP2Q9H3C7 697 aa45.52■■■■■ 4.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 AFF2P51816 1311 aa45.5■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDM11Q9NQV5 511 aa45.5■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFAT5O94916 1531 aa45.48■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM83GA6ND36 823 aa45.48■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 KNSTRNQ9Y448 316 aa45.48■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLCH1Q4KWH8 1693 aa45.47■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLIT2O94813 1529 aa45.46■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOX12O15370 315 aa45.45■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 NWD2Q9ULI1 1742 aa45.43■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa45.4■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSD2O96028 1365 aa45.4■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP21Q9UK80 565 aa45.4■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNA2Q15822 529 aa45.39■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL9LQ86UU0 1499 aa45.39■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF25Q86VW2 580 aa45.38■■■■■ 4.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTG4Q9NY30 223 aa45.35■■■■■ 4.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 LMO7Q8WWI1 1683 aa45.34■■■■■ 4.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 LTN1O94822 1766 aa45.34■■■■■ 4.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP45.33■■■■■ 4.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNC5CLQ8IV45 518 aa45.33■■■■■ 4.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 AATKQ6ZMQ8 1374 aa45.33■■■■■ 4.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB7CA1YPR0 619 aa45.32■■■■■ 4.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRAPQ86VF7 1730 aa45.31■■■■■ 4.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL18A1P39060 1754 aa45.3■■■■■ 4.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC6O95255 1503 aa45.29■■■■■ 4.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa45.27■■■■■ 4.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 POTEAQ6S8J7 498 aa45.26■■■■■ 4.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa45.24■■■■■ 4.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATRNO75882 1429 aa45.24■■■■■ 4.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBLN1P23142 703 aa45.23■■■■■ 4.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP3K19Q56UN5 1328 aa45.21■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms