RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569224.1

DDX19B-215, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 2

Gene DDX19B, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-215	ENST00000569224	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	PSME1	Q06323	249 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	MSH5	O43196	834 aa		13.05	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.05	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.03	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.03	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224		A0A1W2PP64	1363 aa		13.03	□□□□□ -0.32
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.02	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.01	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.01	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	SLIT3	O75094	1523 aa		12.99	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	USP19	O94966	1318 aa		12.98	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.98	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12.98	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		12.98	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		12.97	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	ABTB2	Q8N961	1025 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		12.96	□□□□□ -0.33
DDX19B-215	ENST00000569224	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.95	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	NFAT5	O94916	1531 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	ADAMTS2	O95450	1211 aa		12.94	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	NRAP	Q86VF7	1730 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	SLIT2	O94813	1529 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	NLRP13	Q86W25	1043 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	C8orf37	Q96NL8	207 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	CCDC7	Q96M83	1385 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		12.93	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	NLRP6	P59044	892 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	NME9	Q86XW9	330 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	12.92	□□□□□ -0.34	4e-6	■■■■□ 21.1
DDX19B-215	ENST00000569224	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	CPD	O75976	1380 aa		12.92	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	PLEKHG5	O94827	1062 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	AFF2	P51816	1311 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	COL18A1	P39060	1754 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	KIAA0232	Q92628	1395 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DDX19B-215	ENST00000569224	LTN1	O94822	1766 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	ABCC6	O95255	1503 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	GC	P02774	474 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM83G	A6ND36	823 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	NGLY1	Q96IV0	654 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	ATRN	O75882	1429 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	FYB1	O15117	783 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	PANK3	Q9H999	370 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	POTEA	Q6S8J7	498 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	USP21	Q9UK80	565 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	GLI3	P10071	1580 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	RGPD5	Q99666	1765 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	NSD2	O96028	1365 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	CHRNA2	Q15822	529 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	COG3	Q96JB2	828 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
DDX19B-215	ENST00000569224	BTG4	Q9NY30	223 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	SOX12	O15370	315 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
DDX19B-215	ENST00000569224	PEAK1	Q9H792	1746 aa		12.82	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms