RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 SSH2Q76I76 1423 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 BRINP3Q76B58 766 aa25.61■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 FOXO3O43524 673 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 PSME1Q06323 249 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-210ENST00000568388 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.57■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 NSD2O96028 1365 aa25.56■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 FYB1O15117 783 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 ANP32CO43423 234 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-210ENST00000568388 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 JCADQ9P266 1359 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 PXDNQ92626 1479 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 RALBP1Q15311 655 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 SHPRHQ149N8 1683 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 USP54Q70EL1 1684 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 SBNO1A3KN83 1393 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 USP31Q70CQ4 1352 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 PIK3C2AO00443 1686 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 NME9Q86XW9 330 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 ALS2Q96Q42 1657 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-210ENST00000568388 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 MORC1Q86VD1 984 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 ABTB2Q8N961 1025 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 LRP6O75581 1613 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 MIER1Q8N108 512 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 COG3Q96JB2 828 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 NLRP6P59044 892 aa25.39■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 NLRP13Q86W25 1043 aa25.39■■□□□ 1.66
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF10O15013 1369 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 CCER2I3L3R5 266 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 PPP2R1AP30153 589 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 POTEAQ6S8J7 498 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-210ENST00000568388 USP19O94966 1318 aa25.33■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 SLIT3O75094 1523 aa25.32■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.32■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.32■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.32■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-210ENST00000568388 GCP02774 474 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 NFAT5O94916 1531 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 POLKQ9UBT6 870 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 MTHFSP49914 203 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 ABCA3Q99758 1704 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 FBLN1P23142 703 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 LTN1O94822 1766 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 INSRP06213 1382 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC184Q52MB2 194 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 SOX12O15370 315 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 MRS2Q9HD23 443 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 PEAK1Q9H792 1746 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 CFAP53Q96M91 514 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 CPDO75976 1380 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-210ENST00000568388 RTL1A6NKG5 1358 aa25.15■■□□□ 1.62
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