RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.26■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.24■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 SSH2Q76I76 1423 aa25.23■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.23■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.22■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.22■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 COG3Q96JB2 828 aa25.22■■□□□ 1.63
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INO80E-211ENST00000567987 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 ATF3P18847 181 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.18■■□□□ 1.62
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INO80E-211ENST00000567987 SHPRHQ149N8 1683 aa25.15■■□□□ 1.62
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INO80E-211ENST00000567987 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.14■■□□□ 1.61
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INO80E-211ENST00000567987 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.86■■□□□ 1.57
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INO80E-211ENST00000567987 LTN1O94822 1766 aa24.83■■□□□ 1.57
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