RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 NRAPQ86VF7 1730 aa32.75■■■□□ 2.83
PPP4C-212ENST00000567828 ATAD2Q6PL18 1390 aa32.73■■■□□ 2.83
PPP4C-212ENST00000567828 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
PPP4C-212ENST00000567828 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
PPP4C-212ENST00000567828 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
PPP4C-212ENST00000567828 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
PPP4C-212ENST00000567828 FAM83GA6ND36 823 aa32.68■■■□□ 2.82
PPP4C-212ENST00000567828 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.67■■■□□ 2.82
PPP4C-212ENST00000567828 ACEP12821 1306 aa32.66■■■□□ 2.82
PPP4C-212ENST00000567828 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
PPP4C-212ENST00000567828 VPS72Q15906 364 aa32.64■■■□□ 2.82
PPP4C-212ENST00000567828 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa32.62■■■□□ 2.81
PPP4C-212ENST00000567828 PLEKHG3A1L390 1219 aa32.62■■■□□ 2.81
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
PPP4C-212ENST00000567828 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
PPP4C-212ENST00000567828 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.61■■■□□ 2.81
PPP4C-212ENST00000567828 CABP2Q9NPB3 220 aa32.61■■■□□ 2.81
PPP4C-212ENST00000567828 BTG4Q9NY30 223 aa32.6■■■□□ 2.81
PPP4C-212ENST00000567828 NUTM2GQ5VZR2 741 aa32.58■■■□□ 2.81
PPP4C-212ENST00000567828 NRKQ7Z2Y5 1582 aa32.55■■■□□ 2.8
PPP4C-212ENST00000567828 SEPT12Q8IYM1 358 aa32.54■■■□□ 2.8
PPP4C-212ENST00000567828 PRDM11Q9NQV5 511 aa32.54■■■□□ 2.8
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA0232Q92628 1395 aa32.53■■■□□ 2.8
PPP4C-212ENST00000567828 ABTB2Q8N961 1025 aa32.49■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 AKAP12Q02952 1782 aa32.49■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 EVC2Q86UK5 1308 aa32.49■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 CHRNA2Q15822 529 aa32.48■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 CABP1Q9NZU7 370 aa32.47■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 TONSLQ96HA7 1378 aa32.45■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 USP6P35125 1406 aa32.45■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 A0A0G2JS52 829 aa32.45■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 MYT1Q01538 1121 aa32.45■■■□□ 2.79
PPP4C-212ENST00000567828 USP19O94966 1318 aa32.44■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 PIK3C2AO00443 1686 aa32.43■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32.43■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa32.43■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa32.43■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 LMO7Q8WWI1 1683 aa32.43■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 KRT27Q7Z3Y8 459 aa32.42■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC125Q86Z20 511 aa32.42■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 NLRP13Q86W25 1043 aa32.39■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 STRN4Q9NRL3 753 aa32.39■■■□□ 2.78
PPP4C-212ENST00000567828 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa32.37■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 CARD11Q9BXL7 1154 aa32.37■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 CPDO75976 1380 aa32.36■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 SSH2Q76I76 1423 aa32.35■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 SLIT3O75094 1523 aa32.35■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 MON2Q7Z3U7 1717 aa32.34■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa32.34■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa32.33■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 GCP02774 474 aa32.33■■■□□ 2.77
PPP4C-212ENST00000567828 NLRP6P59044 892 aa32.31■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 RGPD1P0DJD0 1748 aa32.3■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 EVA1CP58658 441 aa32.28■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 COL18A1P39060 1754 aa32.27■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 FAM182BQ5T319 152 aa32.27■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 DEFB132Q7Z7B7 95 aa32.27■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 USP35Q9P2H5 1018 aa32.27■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 RGPD5Q99666 1765 aa32.27■■■□□ 2.76
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB7CA1YPR0 619 aa32.26■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa32.26■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.23■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.23■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.2■■■□□ 2.75
PPP4C-212ENST00000567828 TTC21AQ8NDW8 1320 aa32.2■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 USP54Q70EL1 1684 aa32.18■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 WNK3Q9BYP7 1800 aa32.18■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.18■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 BARGINQ6ZT62 677 aa32.17■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 NFAT5O94916 1531 aa32.16■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 TCP11L2Q8N4U5 519 aa32.15■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 SOX12O15370 315 aa32.14■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 TMC1Q8TDI8 760 aa32.14■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 CRB1P82279 1406 aa32.14■■■□□ 2.74
PPP4C-212ENST00000567828 LTN1O94822 1766 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 BAG6P46379 1132 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.11■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 KCNH5Q8NCM2 988 aa32.11■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.1■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC37A3O60309 1634 aa32.09■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa32.09■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGEF25Q86VW2 580 aa32.09■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 AXIN2Q9Y2T1 843 aa32.09■■■□□ 2.73
PPP4C-212ENST00000567828 TESK2Q96S53 571 aa32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.5 ms