RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
PPP4C-211ENST00000567642 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.14■■■□□ 2.42
PPP4C-211ENST00000567642 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 VPS72Q15906 364 aa30.12■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 ACEP12821 1306 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 NRAPQ86VF7 1730 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.08■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 BTG4Q9NY30 223 aa30.08■■■□□ 2.41
PPP4C-211ENST00000567642 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 CABP2Q9NPB3 220 aa30.07■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.05■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.04■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.03■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PPP4C-211ENST00000567642 A0A0G2JS52 829 aa30.01■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 MYT1Q01538 1121 aa30.01■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 ABTB2Q8N961 1025 aa29.99■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC125Q86Z20 511 aa29.98■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA0232Q92628 1395 aa29.98■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 EP400Q96L91 3159 aa29.98■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 CHRNA2Q15822 529 aa29.96■■■□□ 2.39
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PPP4C-211ENST00000567642 EVC2Q86UK5 1308 aa29.96■■■□□ 2.39
PPP4C-211ENST00000567642 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP4C-211ENST00000567642 CABP1Q9NZU7 370 aa29.94■■■□□ 2.38
PPP4C-211ENST00000567642 STRN4Q9NRL3 753 aa29.91■■■□□ 2.38
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.91■■■□□ 2.38
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.91■■■□□ 2.38
PPP4C-211ENST00000567642 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP13Q86W25 1043 aa29.9■■■□□ 2.38
PPP4C-211ENST00000567642 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PPP4C-211ENST00000567642 TONSLQ96HA7 1378 aa29.89■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 USP6P35125 1406 aa29.86■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 EVA1CP58658 441 aa29.85■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 USP19O94966 1318 aa29.85■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.84■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 AKAP12Q02952 1782 aa29.83■■■□□ 2.37
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 GCP02774 474 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP6P59044 892 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 USP35Q9P2H5 1018 aa29.81■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 CPDO75976 1380 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.79■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 PIK3C2AO00443 1686 aa29.79■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 SSH2Q76I76 1423 aa29.78■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 FAM182BQ5T319 152 aa29.77■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
PPP4C-211ENST00000567642 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
PPP4C-211ENST00000567642 SLIT3O75094 1523 aa29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-211ENST00000567642 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-211ENST00000567642 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.72■■■□□ 2.35
PPP4C-211ENST00000567642 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.72■■■□□ 2.35
PPP4C-211ENST00000567642 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PPP4C-211ENST00000567642 BAG6P46379 1132 aa29.7■■■□□ 2.35
PPP4C-211ENST00000567642 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.7■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 BARGINQ6ZT62 677 aa29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 SOX12O15370 315 aa29.67■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 TMC1Q8TDI8 760 aa29.67■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 RGPD5Q99666 1765 aa29.67■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 COL18A1P39060 1754 aa29.65■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.64■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 PDE3BQ13370 1112 aa29.64■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.64■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
PPP4C-211ENST00000567642 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.62■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 CRB1P82279 1406 aa29.62■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM37O94972 964 aa29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4C-211ENST00000567642 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4C-211ENST00000567642 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4C-211ENST00000567642 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4C-211ENST00000567642 NFAT5O94916 1531 aa29.55■■■□□ 2.32
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