RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.78■■□□□ 1.4
HERC2-208ENST00000566635 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.77■■□□□ 1.4
HERC2-208ENST00000566635 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.77■■□□□ 1.4
HERC2-208ENST00000566635 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.77■■□□□ 1.4
HERC2-208ENST00000566635 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.76■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 SHPRHQ149N8 1683 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 MTHFSP49914 203 aa23.74■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.74■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 PIK3C2AO00443 1686 aa23.74■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 DCCP43146 1447 aa23.73■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.73■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 ORAI2Q96SN7 254 aa23.72■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.72■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 MST1RQ04912 1400 aa23.72■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.72■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 COG3Q96JB2 828 aa23.71■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.71■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 FBLN1P23142 703 aa23.71■■□□□ 1.39
HERC2-208ENST00000566635 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 ATF3P18847 181 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 MSH6P52701 1360 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 KIF1AQ12756 1690 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 CFAP53Q96M91 514 aa23.65■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 INSRP06213 1382 aa23.65■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.65■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 USP54Q70EL1 1684 aa23.64■■□□□ 1.38
HERC2-208ENST00000566635 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.63■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.63■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 POLKQ9UBT6 870 aa23.63■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 USP31Q70CQ4 1352 aa23.62■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 FOXO3O43524 673 aa23.62■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.62■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 PSME1Q06323 249 aa23.61■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.6■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.6■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 SOX12O15370 315 aa23.58■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 ABTB2Q8N961 1025 aa23.58■■□□□ 1.37
HERC2-208ENST00000566635 PEAK1Q9H792 1746 aa23.58■■□□□ 1.36
HERC2-208ENST00000566635 NLRP6P59044 892 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC2-208ENST00000566635 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC2-208ENST00000566635 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
HERC2-208ENST00000566635 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HERC2-208ENST00000566635 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.54■■□□□ 1.36
HERC2-208ENST00000566635 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.53■■□□□ 1.36
HERC2-208ENST00000566635 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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HERC2-208ENST00000566635 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 BRINP3Q76B58 766 aa23.5■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 NUDCQ9Y266 331 aa23.5■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.49■■□□□ 1.35
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HERC2-208ENST00000566635 SLAIN2Q9P270 581 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 NFAT5O94916 1531 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 LTN1O94822 1766 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.47■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.47■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.47■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 APAF1O14727 1248 aa23.46■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 SLIT3O75094 1523 aa23.46■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 IL13P35225 146 aa23.45■■□□□ 1.35
HERC2-208ENST00000566635 SBNO1A3KN83 1393 aa23.45■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHG5O94827 1062 aa23.44■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.44■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 RUNDC1Q96C34 613 aa23.44■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 FLT4P35916 1363 aa23.43■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.42■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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HERC2-208ENST00000566635 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.41■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.4■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 AMPHP49418 695 aa23.4■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.39■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 HMOX1P09601 288 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 ZNF521Q96K83 1311 aa23.37■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 HOXC9P31274 260 aa23.37■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HERC2-208ENST00000566635 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.37■■□□□ 1.33
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