RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCA3Q99758 1704 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTS2O95450 1211 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 NGLY1Q96IV0 654 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 C8orf37Q96NL8 207 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 TESK2Q96S53 571 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 USP6P35125 1406 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 AFF2P51816 1311 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 NLRP13Q86W25 1043 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 ABTB2Q8N961 1025 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 TMC1Q8TDI8 760 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 ILDR2Q71H61 639 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 USP21Q9UK80 565 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-205ENST00000558534 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SSH2Q76I76 1423 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SLIT2O94813 1529 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 RXRBP28702 533 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 POTEAQ6S8J7 498 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SOCS7O14512 581 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHG5O94827 1062 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 USP19O94966 1318 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 PIK3C2AO00443 1686 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 NLRP6P59044 892 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-205ENST00000558534 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PP64 1363 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 USP54Q70EL1 1684 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 SLIT3O75094 1523 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 ATRNO75882 1429 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 CPDO75976 1380 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 GCP02774 474 aa21.91■■□□□ 1.1
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RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA0232Q92628 1395 aa21.89■■□□□ 1.1
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM83GA6ND36 823 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 MYOM1P52179 1685 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 BTG4Q9NY30 223 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS72Q15906 364 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC6O95255 1503 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 COG3Q96JB2 828 aa21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-205ENST00000558534 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 EVA1CP58658 441 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 NME9Q86XW9 330 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 NFAT5O94916 1531 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CHRNA2Q15822 529 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-205ENST00000558534 RGS12O14924 1447 aa21.79■■□□□ 1.08
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RABGGTA-205ENST00000558534 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 COL18A1P39060 1754 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 STRN4Q9NRL3 753 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SOX12O15370 315 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.72■■□□□ 1.07
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