RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.05■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 NRAPQ86VF7 1730 aa36.03■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.01■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.01■■■■□ 3.36
MACROD1-208ENST00000545464 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
MACROD1-208ENST00000545464 ALS2Q96Q42 1657 aa36■■■■□ 3.35
MACROD1-208ENST00000545464 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
MACROD1-208ENST00000545464 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa35.99■■■■□ 3.35
MACROD1-208ENST00000545464 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa35.99■■■■□ 3.35
MACROD1-208ENST00000545464 HRCP23327 699 aa35.93■■■■□ 3.34
MACROD1-208ENST00000545464 CHRNA2Q15822 529 aa35.92■■■■□ 3.34
MACROD1-208ENST00000545464 STRN4Q9NRL3 753 aa35.92■■■■□ 3.34
MACROD1-208ENST00000545464 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
MACROD1-208ENST00000545464 LRP5O75197 1615 aa35.9■■■■□ 3.34
MACROD1-208ENST00000545464 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.9■■■■□ 3.34
MACROD1-208ENST00000545464 KIAA0232Q92628 1395 aa35.89■■■■□ 3.34
MACROD1-208ENST00000545464 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
MACROD1-208ENST00000545464 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
MACROD1-208ENST00000545464 STAC3Q96MF2 364 aa35.86■■■■□ 3.33
MACROD1-208ENST00000545464 RGPD1P0DJD0 1748 aa35.85■■■■□ 3.33
MACROD1-208ENST00000545464 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa35.84■■■■□ 3.33
MACROD1-208ENST00000545464 USP35Q9P2H5 1018 aa35.84■■■■□ 3.33
MACROD1-208ENST00000545464 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.83■■■■□ 3.33
MACROD1-208ENST00000545464 CDK19Q9BWU1 502 aa35.83■■■■□ 3.33
MACROD1-208ENST00000545464 TRIM37O94972 964 aa35.82■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 ATP7BP35670 1465 aa35.81■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 EVA1CP58658 441 aa35.81■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa35.81■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 ITSN1Q15811 1721 aa35.78■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.78■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 ACEP12821 1306 aa35.77■■■■□ 3.32
MACROD1-208ENST00000545464 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.75■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 APBA3O96018 575 aa35.74■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 DISP2A7MBM2 1401 aa35.74■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.73■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 PDE3BQ13370 1112 aa35.72■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 ABTB2Q8N961 1025 aa35.72■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 CAMKK2Q96RR4 588 aa35.71■■■■□ 3.31
MACROD1-208ENST00000545464 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
MACROD1-208ENST00000545464 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
MACROD1-208ENST00000545464 SSH2Q76I76 1423 aa35.67■■■■□ 3.3
MACROD1-208ENST00000545464 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.66■■■■□ 3.3
MACROD1-208ENST00000545464 BARGINQ6ZT62 677 aa35.66■■■■□ 3.3
MACROD1-208ENST00000545464 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.63■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.61■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa35.61■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.6■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.6■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 NLRP13Q86W25 1043 aa35.59■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.59■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.58■■■■□ 3.29
MACROD1-208ENST00000545464 CPDO75976 1380 aa35.56■■■■□ 3.28
MACROD1-208ENST00000545464 GCP02774 474 aa35.56■■■■□ 3.28
MACROD1-208ENST00000545464 CABP2Q9NPB3 220 aa35.56■■■■□ 3.28
MACROD1-208ENST00000545464 USP19O94966 1318 aa35.56■■■■□ 3.28
MACROD1-208ENST00000545464 NBPF14Q5TI25 921 aa35.55■■■■□ 3.28
MACROD1-208ENST00000545464 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.55■■■■□ 3.28
MACROD1-208ENST00000545464 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
MACROD1-208ENST00000545464 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.27
MACROD1-208ENST00000545464 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.49■■■■□ 3.27
MACROD1-208ENST00000545464 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.49■■■■□ 3.27
MACROD1-208ENST00000545464 NLRP6P59044 892 aa35.47■■■■□ 3.27
MACROD1-208ENST00000545464 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
MACROD1-208ENST00000545464 CABP1Q9NZU7 370 aa35.45■■■■□ 3.27
MACROD1-208ENST00000545464 RREB1Q92766 1687 aa35.43■■■■□ 3.26
MACROD1-208ENST00000545464 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.43■■■■□ 3.26
MACROD1-208ENST00000545464 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
MACROD1-208ENST00000545464 CRB1P82279 1406 aa35.41■■■■□ 3.26
MACROD1-208ENST00000545464 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.39■■■■□ 3.26
MACROD1-208ENST00000545464 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 SPON1Q9HCB6 807 aa35.37■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 USP6P35125 1406 aa35.37■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa35.36■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.36■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 DDB1Q16531 1140 aa35.36■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.36■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.36■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.33■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 KCNQ2O43526 872 aa35.33■■■■□ 3.25
MACROD1-208ENST00000545464 SOX12O15370 315 aa35.31■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 YY1P25490 414 aa35.31■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.3■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 EVC2Q86UK5 1308 aa35.29■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 SLIT3O75094 1523 aa35.28■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.28■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 PLSCR1O15162 318 aa35.27■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 DCAF8L1A6NGE4 600 aa35.26■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa35.26■■■■□ 3.24
MACROD1-208ENST00000545464 WDR17Q8IZU2 1322 aa35.26■■■■□ 3.23
MACROD1-208ENST00000545464 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
MACROD1-208ENST00000545464 LRRC37A3O60309 1634 aa35.24■■■■□ 3.23
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