RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADAMTS2O95450 1211 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SOCS7O14512 581 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLIT2O94813 1529 aa22.89■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NGLY1Q96IV0 654 aa22.89■■□□□ 1.25
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIK3C2AO00443 1686 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.85■■□□□ 1.25
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP54Q70EL1 1684 aa22.84■■□□□ 1.25
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.8■■□□□ 1.24
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.79■■□□□ 1.24
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP19O94966 1318 aa22.79■■□□□ 1.24
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABTB2Q8N961 1025 aa22.77■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGS12O14924 1447 aa22.76■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.76■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.75■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYOM1P52179 1685 aa22.74■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLEKHG5O94827 1062 aa22.74■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NLRP13Q86W25 1043 aa22.74■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.74■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CPDO75976 1380 aa22.73■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM83GA6ND36 823 aa22.72■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMF1P82094 1093 aa22.72■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.71■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA0232Q92628 1395 aa22.71■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1W2PP64 1363 aa22.7■■□□□ 1.22
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMC1Q8TDI8 760 aa22.68■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.68■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.68■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.67■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL18A1P39060 1754 aa22.67■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NFAT5O94916 1531 aa22.67■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NLRP6P59044 892 aa22.66■■□□□ 1.22
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.65■■□□□ 1.22
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 LTN1O94822 1766 aa22.65■■□□□ 1.22
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.64■■□□□ 1.21
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGPD5Q99666 1765 aa22.62■■□□□ 1.21
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.6■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.6■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHRNA2Q15822 529 aa22.59■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.59■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.59■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NME9Q86XW9 330 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EP400Q96L91 3159 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STRN4Q9NRL3 753 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRB1P82279 1406 aa22.5■■□□□ 1.19
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