RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 NGLY1Q96IV0 654 aa20.54■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF10O15013 1369 aa20.54■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 AKAP12Q02952 1782 aa20.54■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 TMF1P82094 1093 aa20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-208ENST00000528920 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 RGS12O14924 1447 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 ABCA3Q99758 1704 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 USP6P35125 1406 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 SSH2Q76I76 1423 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CDCA8Q53HL2 280 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 TMC1Q8TDI8 760 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 USP21Q9UK80 565 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-208ENST00000528920 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.45■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 PLEKHG5O94827 1062 aa20.42■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 ABTB2Q8N961 1025 aa20.42■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.42■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 PIK3C2AO00443 1686 aa20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 MYOM1P52179 1685 aa20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1W2PP64 1363 aa20.4■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.4■□□□□ 0.86
TSTA3-208ENST00000528920 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.39■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 NLRP13Q86W25 1043 aa20.38■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 USP19O94966 1318 aa20.37■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 ATRNO75882 1429 aa20.36■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.36■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 NLRP6P59044 892 aa20.35■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.34■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 USP54Q70EL1 1684 aa20.34■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.33■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 SLIT3O75094 1523 aa20.33■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 SLIT2O94813 1529 aa20.33■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
TSTA3-208ENST00000528920 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 FAM83GA6ND36 823 aa20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 GCP02774 474 aa20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 USP31Q70CQ4 1352 aa20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 NME9Q86XW9 330 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA0232Q92628 1395 aa20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.28■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.28■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 CPDO75976 1380 aa20.28■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 NRAPQ86VF7 1730 aa20.27■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.27■□□□□ 0.84
TSTA3-208ENST00000528920 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.26■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.26■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.26■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.26■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.25■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.25■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 NFAT5O94916 1531 aa20.24■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.24■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 CHRNA2Q15822 529 aa20.24■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 BTG4Q9NY30 223 aa20.24■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.23■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC125Q86Z20 511 aa20.22■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 COL18A1P39060 1754 aa20.21■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 FYB1O15117 783 aa20.21■□□□□ 0.83
TSTA3-208ENST00000528920 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 SOX12O15370 315 aa20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 VPS72Q15906 364 aa20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 COG3Q96JB2 828 aa20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 LTN1O94822 1766 aa20.19■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 PANK3Q9H999 370 aa20.19■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC7Q96M83 1385 aa20.19■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 GLI3P10071 1580 aa20.18■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.18■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.18■□□□□ 0.82
TSTA3-208ENST00000528920 RGPD5Q99666 1765 aa20.17■□□□□ 0.82
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