RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
HMBOX1-211ENST00000524238 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.34□□□□□ -0.91
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF428Q96B54 188 aa9.34□□□□□ -0.91
HMBOX1-211ENST00000524238 GCC1Q96CN9 775 aa9.34□□□□□ -0.91
HMBOX1-211ENST00000524238 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HMBOX1-211ENST00000524238 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.34□□□□□ -0.91
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF1BO60333 1816 aa9.34□□□□□ -0.91
HMBOX1-211ENST00000524238 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.33□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCA6Q8N139 1617 aa9.33□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 NEUROD2Q15784 382 aa9.33□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.33□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.33□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.32□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.32□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.32□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.32□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 IFT172Q9UG01 1749 aa9.32□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.32□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM27P14373 513 aa9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 RABEP1Q15276 862 aa9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCC1P33527 1531 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 PLCH2O75038 1416 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 UQCRHP07919 91 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 TNNQ9UQP3 1299 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 NOS1P29475 1434 aa9.29□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 CDC45O75419 566 aa9.29□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 RIPK4P57078 832 aa9.29□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.29□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 MBD3O95983 291 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 MTHFSP49914 203 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 MED14O60244 1454 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 SSFA2P28290 1259 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 KLHL34Q8N239 644 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF2CQ99661 725 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.28□□□□□ -0.92
HMBOX1-211ENST00000524238 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 ST18O60284 1047 aa9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 FBLN2P98095 1184 aa9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 CASC1Q6TDU7 716 aa9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 LNPKQ9C0E8 428 aa9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 FANCAO15360 1455 aa9.26□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.26□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.26□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.26□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.26□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.26□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 PHF14O94880 888 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 MCTP1Q6DN14 999 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 PIK3R4Q99570 1358 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.25□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.24□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.23□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 PTCH1Q13635 1447 aa9.23□□□□□ -0.93
HMBOX1-211ENST00000524238 EVC2Q86UK5 1308 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms