RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495695.1

LAMA5-212, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 780 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-212ENST00000495695 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.2■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.2■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 ALS2Q96Q42 1657 aa29.2■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 NRAPQ86VF7 1730 aa29.2■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.18■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 LRP5O75197 1615 aa29.18■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.17■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.17■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.16■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 HRCP23327 699 aa29.14■■■□□ 2.26
LAMA5-212ENST00000495695 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
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LAMA5-212ENST00000495695 DISP2A7MBM2 1401 aa29.1■■■□□ 2.25
LAMA5-212ENST00000495695 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.09■■■□□ 2.25
LAMA5-212ENST00000495695 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.08■■■□□ 2.25
LAMA5-212ENST00000495695 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.08■■■□□ 2.25
LAMA5-212ENST00000495695 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.06■■■□□ 2.24
LAMA5-212ENST00000495695 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.05■■■□□ 2.24
LAMA5-212ENST00000495695 ATP7BP35670 1465 aa29.05■■■□□ 2.24
LAMA5-212ENST00000495695 KIAA0232Q92628 1395 aa29.05■■■□□ 2.24
LAMA5-212ENST00000495695 ITSN1Q15811 1721 aa29.04■■■□□ 2.24
LAMA5-212ENST00000495695 FAM182BQ5T319 152 aa29.04■■■□□ 2.24
LAMA5-212ENST00000495695 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.03■■■□□ 2.24
LAMA5-212ENST00000495695 CDK19Q9BWU1 502 aa29.02■■■□□ 2.24
LAMA5-212ENST00000495695 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.01■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 EVA1CP58658 441 aa29■■■□□ 2.23
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LAMA5-212ENST00000495695 BARGINQ6ZT62 677 aa29■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 STRN4Q9NRL3 753 aa29■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.99■■■□□ 2.23
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LAMA5-212ENST00000495695 ACEP12821 1306 aa28.97■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 TRIM37O94972 964 aa28.97■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 PDE3BQ13370 1112 aa28.96■■■□□ 2.23
LAMA5-212ENST00000495695 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 APBA3O96018 575 aa28.94■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 ABTB2Q8N961 1025 aa28.94■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 CPDO75976 1380 aa28.93■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.92■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 SSH2Q76I76 1423 aa28.92■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.91■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 USP35Q9P2H5 1018 aa28.91■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 NLRP13Q86W25 1043 aa28.9■■■□□ 2.22
LAMA5-212ENST00000495695 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
LAMA5-212ENST00000495695 NBPF14Q5TI25 921 aa28.88■■■□□ 2.21
LAMA5-212ENST00000495695 USP19O94966 1318 aa28.88■■■□□ 2.21
LAMA5-212ENST00000495695 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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LAMA5-212ENST00000495695 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.86■■■□□ 2.21
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LAMA5-212ENST00000495695 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.85■■■□□ 2.21
LAMA5-212ENST00000495695 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
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LAMA5-212ENST00000495695 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.8■■■□□ 2.2
LAMA5-212ENST00000495695 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.78■■■□□ 2.2
LAMA5-212ENST00000495695 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
LAMA5-212ENST00000495695 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.77■■■□□ 2.2
LAMA5-212ENST00000495695 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 CRB1P82279 1406 aa28.75■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 RREB1Q92766 1687 aa28.74■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.74■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 CABP2Q9NPB3 220 aa28.73■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 NLRP6P59044 892 aa28.72■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 SPON1Q9HCB6 807 aa28.72■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 PLSCR1O15162 318 aa28.71■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LAMA5-212ENST00000495695 CABP1Q9NZU7 370 aa28.7■■■□□ 2.18
LAMA5-212ENST00000495695 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.69■■■□□ 2.18
LAMA5-212ENST00000495695 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.69■■■□□ 2.18
LAMA5-212ENST00000495695 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.69■■■□□ 2.18
LAMA5-212ENST00000495695 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.69■■■□□ 2.18
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LAMA5-212ENST00000495695 DDB1Q16531 1140 aa28.68■■■□□ 2.18
LAMA5-212ENST00000495695 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
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LAMA5-212ENST00000495695 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.66■■■□□ 2.18
LAMA5-212ENST00000495695 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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LAMA5-212ENST00000495695 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
LAMA5-212ENST00000495695 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
LAMA5-212ENST00000495695 EVC2Q86UK5 1308 aa28.64■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 SLIT3O75094 1523 aa28.64■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.63■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.62■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.62■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.61■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 YY1P25490 414 aa28.6■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 PEAK1Q9H792 1746 aa28.6■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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