RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.95■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 BAG6P46379 1132 aa24.92■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 FAM182BQ5T319 152 aa24.91■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.9■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.88■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.88■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.88■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 STAC3Q96MF2 364 aa24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 ITSN1Q15811 1721 aa24.86■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.84■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 LRP5O75197 1615 aa24.83■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 CHRNA2Q15822 529 aa24.83■■□□□ 1.57
TOP3B-217ENST00000489581 ATP7BP35670 1465 aa24.83■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.82■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA0232Q92628 1395 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 HRCP23327 699 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 CDK19Q9BWU1 502 aa24.81■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 STRN4Q9NRL3 753 aa24.8■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.79■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TOP3B-217ENST00000489581 ACEP12821 1306 aa24.76■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.75■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 USP35Q9P2H5 1018 aa24.75■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 TRIM37O94972 964 aa24.74■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 DISP2A7MBM2 1401 aa24.73■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 EVA1CP58658 441 aa24.73■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.73■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.72■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.72■■□□□ 1.55
TOP3B-217ENST00000489581 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.7■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 ABTB2Q8N961 1025 aa24.7■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.69■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.68■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.68■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 SSH2Q76I76 1423 aa24.68■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.67■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 APBA3O96018 575 aa24.67■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 PDE3BQ13370 1112 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 BARGINQ6ZT62 677 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.66■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TOP3B-217ENST00000489581 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.63■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 USP19O94966 1318 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 GCP02774 474 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 NLRP13Q86W25 1043 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 CPDO75976 1380 aa24.62■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.61■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 CABP2Q9NPB3 220 aa24.61■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.58■■□□□ 1.53
TOP3B-217ENST00000489581 RREB1Q92766 1687 aa24.57■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.57■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.55■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.54■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 CABP1Q9NZU7 370 aa24.54■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 NLRP6P59044 892 aa24.53■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF14Q5TI25 921 aa24.53■■□□□ 1.52
TOP3B-217ENST00000489581 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 USP6P35125 1406 aa24.51■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 CRB1P82279 1406 aa24.5■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 SBF2Q86WG5 1849 aa24.47■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.47■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.46■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 SLIT3O75094 1523 aa24.45■■□□□ 1.51
TOP3B-217ENST00000489581 COL18A1P39060 1754 aa24.45■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 PEAK1Q9H792 1746 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 PIK3C2AO00443 1686 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 DDB1Q16531 1140 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.44■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 LRRC37A3O60309 1634 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 EVC2Q86UK5 1308 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 RGPD5Q99666 1765 aa24.43■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 SPON1Q9HCB6 807 aa24.42■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 SOX12O15370 315 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.4■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TOP3B-217ENST00000489581 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms