RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNH2Q12809 1159 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAK2O60296 914 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 IRF5Q13568 498 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF223E7ERA6 249 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 ARID3CA6NKF2 412 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 GGCXP38435 758 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 PNMA1Q8ND90 353 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 POM121CA8CG34 1229 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 VAC14Q08AM6 782 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 WWC1Q8IX03 1113 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01559Q495D7 138 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 WASHC4Q2M389 1173 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 BAP1Q92560 729 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO45P0C2W1 286 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF14Q5TI25 921 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBBXA8MT70 800 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 NR1H3Q13133 447 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF511Q8NB15 262 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.377e-7■□□□□ 11
RABGGTB-211ENST00000489450 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM32Q13049 653 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXJ1Q92949 421 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3BP2P78314 561 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 PTK2Q05397 1052 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF787Q6DD87 383 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 GLMNQ92990 594 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC19A1P41440 591 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 RPIAP49247 311 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 SKOR1P84550 965 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 AGERQ15109 404 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ARID3AQ99856 593 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB33Q86T24 672 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM32Q8TC27 787 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 SEMA3FQ13275 785 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRYD7Q5W111 196 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ALG2Q9H553 416 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX11P35716 441 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 WNT7BP56706 349 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ERFEQ4G0M1 354 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR20EP86478 221 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR20CP86479 221 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR20DP86480 221 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR20BP86481 221 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR20AP86496 221 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-211ENST00000489450 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 UCN2Q96RP3 112 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 PIK3CDO00329 1044 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 DGAT1O75907 488 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 MYT1Q01538 1121 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 GDF9O60383 454 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-211ENST00000489450 PKDCCQ504Y2 493 aa6.37□□□□□ -1.39
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