RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	24.66	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	24.66	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	EVC2	Q86UK5	1308 aa		24.65	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM83G	A6ND36	823 aa		24.65	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		24.65	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		24.64	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA3	Q99758	1704 aa		24.64	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	24.64	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC125	Q86Z20	511 aa		24.63	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		24.63	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		24.62	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		24.61	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TONSL	Q96HA7	1378 aa		24.61	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		24.61	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		24.6	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	24.59	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CABP2	Q9NPB3	220 aa		24.59	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		24.59	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC24A1	O60721	1099 aa		24.58	■■□□□ 1.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP13	Q86W25	1043 aa		24.57	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	24.56	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	BTG4	Q9NY30	223 aa		24.56	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CABP1	Q9NZU7	370 aa		24.56	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ABTB2	Q8N961	1025 aa		24.55	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		24.55	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		24.55	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	USP19	O94966	1318 aa		24.55	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GLI3	P10071	1580 aa		24.54	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		24.54	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		24.54	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	24.54	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		24.53	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CPD	O75976	1380 aa		24.53	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	USP6	P35125	1406 aa		24.52	■■□□□ 1.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		24.51	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		24.5	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		24.5	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SSH2	Q76I76	1423 aa		24.5	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	24.49	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		24.49	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		24.49	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0232	Q92628	1395 aa		24.49	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GC	P02774	474 aa		24.48	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	24.48	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		24.46	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	24.45	■■□□□ 1.51
HDAC10-216	ENST00000489424	NRAP	Q86VF7	1730 aa		24.45	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		24.44	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP6	P59044	892 aa		24.43	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	24.43	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		24.43	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		24.41	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		24.41	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	24.41	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	24.41	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		24.4	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	EP400	Q96L91	3159 aa		24.4	■■□□□ 1.5
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		24.39	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		24.39	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		24.38	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	EVA1C	P58658	441 aa		24.38	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNA2	Q15822	529 aa		24.38	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SLIT3	O75094	1523 aa		24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		24.37	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	24.36	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TESK2	Q96S53	571 aa		24.35	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	USP31	Q70CQ4	1352 aa		24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		24.34	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JS52	829 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	MYT1	Q01538	1121 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	STRN4	Q9NRL3	753 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		24.33	■■□□□ 1.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		24.32	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		24.31	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		24.3	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAP12	Q02952	1782 aa		24.29	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		24.28	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3C2A	O00443	1686 aa		24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CRB1	P82279	1406 aa		24.27	■■□□□ 1.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CDCA8	Q53HL2	280 aa		24.26	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		24.26	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TMC1	Q8TDI8	760 aa		24.26	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC6	O95255	1503 aa		24.25	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	24.25	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	BAG6	P46379	1132 aa		24.24	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TMF1	P82094	1093 aa		24.24	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		24.24	■■□□□ 1.47
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		24.23	■■□□□ 1.47

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