RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa18.37■□□□□ 0.53
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PRAME-212ENST00000485532 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.17■□□□□ 0.5
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PRAME-212ENST00000485532 NLRP6P59044 892 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 EVC2Q86UK5 1308 aa18.11■□□□□ 0.49
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PRAME-212ENST00000485532 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 BARGINQ6ZT62 677 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 AKAP12Q02952 1782 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 SLIT3O75094 1523 aa18.08■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
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PRAME-212ENST00000485532 COL18A1P39060 1754 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 PDE3BQ13370 1112 aa18.06■□□□□ 0.48
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PRAME-212ENST00000485532 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
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PRAME-212ENST00000485532 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 CARD11Q9BXL7 1154 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 LRRC37A3O60309 1634 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 RREB1Q92766 1687 aa17.99■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa17.99■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF25Q86VW2 580 aa17.99■□□□□ 0.47
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