RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa18.37■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 CDK19Q9BWU1 502 aa18.36■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 BTG4Q9NY30 223 aa18.36■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.34■□□□□ 0.53
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PRAME-212ENST00000485532 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PRAME-212ENST00000485532 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.33■□□□□ 0.52
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PRAME-212ENST00000485532 DEFB132Q7Z7B7 95 aa18.31■□□□□ 0.52
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PRAME-212ENST00000485532 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.3■□□□□ 0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.3■□□□□ 0.52
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PRAME-212ENST00000485532 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0232Q92628 1395 aa18.28■□□□□ 0.52
PRAME-212ENST00000485532 FAM182BQ5T319 152 aa18.27■□□□□ 0.52
PRAME-212ENST00000485532 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.27■□□□□ 0.52
PRAME-212ENST00000485532 CCDC61Q9Y6R9 512 aa18.27■□□□□ 0.52
PRAME-212ENST00000485532 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.27■□□□□ 0.52
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PRAME-212ENST00000485532 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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PRAME-212ENST00000485532 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
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PRAME-212ENST00000485532 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.22■□□□□ 0.51
PRAME-212ENST00000485532 ABTB2Q8N961 1025 aa18.22■□□□□ 0.51
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PRAME-212ENST00000485532 NEUROD1Q13562 356 aa18.21■□□□□ 0.51
PRAME-212ENST00000485532 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.21■□□□□ 0.51
PRAME-212ENST00000485532 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.2■□□□□ 0.5
PRAME-212ENST00000485532 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-212ENST00000485532 CABP1Q9NZU7 370 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-212ENST00000485532 USP35Q9P2H5 1018 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-212ENST00000485532 USP19O94966 1318 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-212ENST00000485532 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-212ENST00000485532 SSH2Q76I76 1423 aa18.16■□□□□ 0.5
PRAME-212ENST00000485532 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.16■□□□□ 0.5
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PRAME-212ENST00000485532 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.13■□□□□ 0.49
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PRAME-212ENST00000485532 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 PIK3C2AO00443 1686 aa18.12■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 NLRP6P59044 892 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 EVC2Q86UK5 1308 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 TRIM37O94972 964 aa18.1■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 BARGINQ6ZT62 677 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 AKAP12Q02952 1782 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 SLIT3O75094 1523 aa18.08■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PRAME-212ENST00000485532 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.08■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 FAM196AQ6ZSG2 479 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 COL18A1P39060 1754 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 PDE3BQ13370 1112 aa18.06■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 DISP2A7MBM2 1401 aa18.06■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 RGPD5Q99666 1765 aa18.05■□□□□ 0.48
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PRAME-212ENST00000485532 APBA3O96018 575 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 LRP5O75197 1615 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 CAMKK2Q96RR4 588 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 CRB1P82279 1406 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PRAME-212ENST00000485532 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 CARD11Q9BXL7 1154 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 LRRC37A3O60309 1634 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 RREB1Q92766 1687 aa17.99■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa17.99■□□□□ 0.47
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF25Q86VW2 580 aa17.99■□□□□ 0.47
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