RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 PLEKHG3A1L390 1219 aa40.89■■■■■ 4.14
CHTF18-209ENST00000479976 ACEP12821 1306 aa40.89■■■■■ 4.14
CHTF18-209ENST00000479976 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.14
CHTF18-209ENST00000479976 NBPF8Q3BBV2 869 aa40.88■■■■■ 4.13
CHTF18-209ENST00000479976 EP400Q96L91 3159 aa40.86■■■■■ 4.13
CHTF18-209ENST00000479976 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa40.86■■■■■ 4.13
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CHTF18-209ENST00000479976 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.82■■■■■ 4.12
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CHTF18-209ENST00000479976 SEPT12Q8IYM1 358 aa40.78■■■■■ 4.12
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CHTF18-209ENST00000479976 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa40.62■■■■■ 4.09
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CHTF18-209ENST00000479976 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa40.5■■■■■ 4.07
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CHTF18-209ENST00000479976 NLRP6P59044 892 aa40.48■■■■■ 4.07
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
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CHTF18-209ENST00000479976 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa40.44■■■■■ 4.06
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CHTF18-209ENST00000479976 SLIT3O75094 1523 aa40.35■■■■■ 4.05
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CHTF18-209ENST00000479976 PDE3BQ13370 1112 aa40.22■■■■■ 4.03
CHTF18-209ENST00000479976 ARHGEF25Q86VW2 580 aa40.21■■■■■ 4.03
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CHTF18-209ENST00000479976 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.2■■■■■ 4.03
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CHTF18-209ENST00000479976 AXIN2Q9Y2T1 843 aa40.19■■■■■ 4.02
CHTF18-209ENST00000479976 COL18A1P39060 1754 aa40.18■■■■■ 4.02
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CHTF18-209ENST00000479976 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.18■■■■■ 4.02
CHTF18-209ENST00000479976 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.18■■■■■ 4.02
CHTF18-209ENST00000479976 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.17■■■■■ 4.02
CHTF18-209ENST00000479976 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
CHTF18-209ENST00000479976 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
CHTF18-209ENST00000479976 TESK2Q96S53 571 aa40.15■■■■■ 4.02
CHTF18-209ENST00000479976 SLC24A1O60721 1099 aa40.13■■■■■ 4.01
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CHTF18-209ENST00000479976 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa40.13■■■■■ 4.01
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