RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 VPS72Q15906 364 aa20.63■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 NRAPQ86VF7 1730 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 FAM83GA6ND36 823 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 NEUROD1Q13562 356 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 ACEP12821 1306 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 BTG4Q9NY30 223 aa20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 CABP2Q9NPB3 220 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC125Q86Z20 511 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA0232Q92628 1395 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 A0A0G2JS52 829 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 MYT1Q01538 1121 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-218ENST00000479554 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 ABTB2Q8N961 1025 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 EVC2Q86UK5 1308 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 CHRNA2Q15822 529 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 USP19O94966 1318 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 USP6P35125 1406 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 CABP1Q9NZU7 370 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 TONSLQ96HA7 1378 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 NLRP13Q86W25 1043 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 CPDO75976 1380 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 STRN4Q9NRL3 753 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 SSH2Q76I76 1423 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 PIK3C2AO00443 1686 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 GCP02774 474 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 EVA1CP58658 441 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 AKAP12Q02952 1782 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4B-218ENST00000479554 SLIT3O75094 1523 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 NLRP6P59044 892 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 USP35Q9P2H5 1018 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 BAG6P46379 1132 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 FAM182BQ5T319 152 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 BARGINQ6ZT62 677 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 CRB1P82279 1406 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 COL18A1P39060 1754 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 PDE3BQ13370 1112 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 NFAT5O94916 1531 aa20.27■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 DISP2A7MBM2 1401 aa20.27■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 SOX12O15370 315 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 TMC1Q8TDI8 760 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 USP54Q70EL1 1684 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM37O94972 964 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms