RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 PLCH1Q4KWH8 1693 aa31.6■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 ALS2Q96Q42 1657 aa31.6■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 A0A0G2JS52 829 aa31.59■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 MYT1Q01538 1121 aa31.59■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.59■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 NUTM2GQ5VZR2 741 aa31.59■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 SEPT12Q8IYM1 358 aa31.59■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 GLI3P10071 1580 aa31.59■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 NWD2Q9ULI1 1742 aa31.58■■■□□ 2.65
RBMS1-211ENST00000477486 PRDM11Q9NQV5 511 aa31.57■■■□□ 2.64
RBMS1-211ENST00000477486 PLEKHG3A1L390 1219 aa31.56■■■□□ 2.64
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC125Q86Z20 511 aa31.56■■■□□ 2.64
RBMS1-211ENST00000477486 CABP2Q9NPB3 220 aa31.56■■■□□ 2.64
RBMS1-211ENST00000477486 ABTB2Q8N961 1025 aa31.52■■■□□ 2.64
RBMS1-211ENST00000477486 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
RBMS1-211ENST00000477486 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa31.49■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 CHRNA2Q15822 529 aa31.48■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 KRT27Q7Z3Y8 459 aa31.48■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa31.46■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31.46■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 KIAA0232Q92628 1395 aa31.45■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 BRWD3Q6RI45 1802 aa31.45■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 CABP1Q9NZU7 370 aa31.45■■■□□ 2.63
RBMS1-211ENST00000477486 EVC2Q86UK5 1308 aa31.45■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 STRN4Q9NRL3 753 aa31.44■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 EVA1CP58658 441 aa31.42■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 NLRP13Q86W25 1043 aa31.42■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 ZRANB1Q9UGI0 708 aa31.42■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.42■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 NRAPQ86VF7 1730 aa31.41■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa31.41■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa31.41■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa31.41■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
RBMS1-211ENST00000477486 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
RBMS1-211ENST00000477486 USP35Q9P2H5 1018 aa31.35■■■□□ 2.61
RBMS1-211ENST00000477486 ZBTB7CA1YPR0 619 aa31.34■■■□□ 2.61
RBMS1-211ENST00000477486 TONSLQ96HA7 1378 aa31.33■■■□□ 2.61
RBMS1-211ENST00000477486 GCP02774 474 aa31.33■■■□□ 2.61
RBMS1-211ENST00000477486 NLRP6P59044 892 aa31.33■■■□□ 2.61
RBMS1-211ENST00000477486 DEFB132Q7Z7B7 95 aa31.33■■■□□ 2.61
RBMS1-211ENST00000477486 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.32■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa31.31■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 EP400Q96L91 3159 aa31.31■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 USP19O94966 1318 aa31.29■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 FAM182BQ5T319 152 aa31.29■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 USP6P35125 1406 aa31.29■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
RBMS1-211ENST00000477486 CPDO75976 1380 aa31.25■■■□□ 2.59
RBMS1-211ENST00000477486 NRKQ7Z2Y5 1582 aa31.25■■■□□ 2.59
RBMS1-211ENST00000477486 BAG6P46379 1132 aa31.24■■■□□ 2.59
RBMS1-211ENST00000477486 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
RBMS1-211ENST00000477486 SSH2Q76I76 1423 aa31.23■■■□□ 2.59
RBMS1-211ENST00000477486 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa31.21■■■□□ 2.59
RBMS1-211ENST00000477486 PDE3BQ13370 1112 aa31.2■■■□□ 2.59
RBMS1-211ENST00000477486 TCP11L2Q8N4U5 519 aa31.2■■■□□ 2.59
RBMS1-211ENST00000477486 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa31.19■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 BARGINQ6ZT62 677 aa31.18■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 SOX12O15370 315 aa31.17■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 TMC1Q8TDI8 760 aa31.17■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa31.16■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 FAM196AQ6ZSG2 479 aa31.16■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 KCNH5Q8NCM2 988 aa31.14■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 TTC21AQ8NDW8 1320 aa31.14■■■□□ 2.58
RBMS1-211ENST00000477486 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP31.12■■■□□ 2.572e-7■■■□□ 14.7
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RBMS1-211ENST00000477486 AATKQ6ZMQ8 1374 aa31.11■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa31.11■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 PIK3C2AO00443 1686 aa31.1■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa31.1■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 AKAP12Q02952 1782 aa31.09■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 SLIT3O75094 1523 aa31.08■■■□□ 2.57
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RBMS1-211ENST00000477486 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 CRB1P82279 1406 aa31.07■■■□□ 2.57
RBMS1-211ENST00000477486 RGPD1P0DJD0 1748 aa31.07■■■□□ 2.56
RBMS1-211ENST00000477486 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa31.06■■■□□ 2.56
RBMS1-211ENST00000477486 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa31.06■■■□□ 2.56
RBMS1-211ENST00000477486 ARHGEF25Q86VW2 580 aa31.05■■■□□ 2.56
RBMS1-211ENST00000477486 AXIN2Q9Y2T1 843 aa31.05■■■□□ 2.56
RBMS1-211ENST00000477486 APBA3O96018 575 aa31.04■■■□□ 2.56
RBMS1-211ENST00000477486 TERF2IPQ9NYB0 399 aa31.03■■■□□ 2.56
RBMS1-211ENST00000477486 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
RBMS1-211ENST00000477486 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.01■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 NME9Q86XW9 330 aa31■■■□□ 2.55
RBMS1-211ENST00000477486 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.99■■■□□ 2.55
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