RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.22■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 KANK1Q14678 1352 aa22.22■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.22■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 OFD1O75665 1012 aa22.21■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 MCTP1Q6DN14 999 aa22.21■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 STAC3Q96MF2 364 aa22.21■■□□□ 1.15
PREB-208ENST00000468045 KIF3BO15066 747 aa22.2■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 ABCA6Q8N139 1617 aa22.2■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 PKP1Q13835 747 aa22.2■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.2■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.19■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 CD109Q6YHK3 1445 aa22.19■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.17■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 RBSNQ9H1K0 784 aa22.17■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.16■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.16■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.16■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 SLC24A1O60721 1099 aa22.16■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.15■■□□□ 1.14
PREB-208ENST00000468045 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.13■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.13■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.13■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 CABP2Q9NPB3 220 aa22.12■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 NOS1P29475 1434 aa22.11■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.11■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 SHROOM2Q13796 1616 aa22.11■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 PTMSP20962 102 aa22.1■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.1■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 PLCH2O75038 1416 aa22.1■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.09■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.09■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.08■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 UQCRHP07919 91 aa22.08■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PREB-208ENST00000468045 KIF16BQ96L93 1317 aa22.07■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 ZNF445P59923 1031 aa22.06■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.06■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.06■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 GPT2Q8TD30 523 aa22.05■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.05■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 FBLN1P23142 703 aa22.05■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.05■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 ADGRB2O60241 1585 aa22.04■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 TSPYL6Q8N831 410 aa22.04■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 MPNDQ8N594 471 aa22.04■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 RNF214Q8ND24 703 aa22.04■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 ABCC1P33527 1531 aa22.04■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 MYOM2P54296 1465 aa22.04■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 CDC45O75419 566 aa22.03■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.03■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 ABCC11Q96J66 1382 aa22.03■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.03■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 SYCE3A1L190 88 aa22.02■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 GCC1Q96CN9 775 aa22.02■■□□□ 1.12
PREB-208ENST00000468045 TET3O43151 1660 aa22.01■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 MROH2AA6NES4 1674 aa22.01■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 APBB1O00213 710 aa22■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 PDLIM2Q96JY6 352 aa22■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.99■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.98■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.98■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.98■■□□□ 1.11
PREB-208ENST00000468045 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.98■■□□□ 1.11
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