RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-205	ENST00000466861	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SUMO3-205	ENST00000466861	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SUMO3-205	ENST00000466861	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SUMO3-205	ENST00000466861	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	TMC1	Q8TDI8	760 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SUMO3-205	ENST00000466861	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	NLRP13	Q86W25	1043 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	USP19	O94966	1318 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	AFF2	P51816	1311 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SUMO3-205	ENST00000466861		A0A1W2PP64	1363 aa		32.45	■■■□□ 2.78
SUMO3-205	ENST00000466861	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SUMO3-205	ENST00000466861	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SUMO3-205	ENST00000466861	NLRP6	P59044	892 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SUMO3-205	ENST00000466861	SLIT2	O94813	1529 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SUMO3-205	ENST00000466861	MYOM1	P52179	1685 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SUMO3-205	ENST00000466861	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SUMO3-205	ENST00000466861	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SUMO3-205	ENST00000466861	SLIT3	O75094	1523 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	USP31	Q70CQ4	1352 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	USP21	Q9UK80	565 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	CPD	O75976	1380 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	GC	P02774	474 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SUMO3-205	ENST00000466861	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
SUMO3-205	ENST00000466861	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SUMO3-205	ENST00000466861	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.31	■■■□□ 2.76
SUMO3-205	ENST00000466861	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SUMO3-205	ENST00000466861	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SUMO3-205	ENST00000466861	KIAA0232	Q92628	1395 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SUMO3-205	ENST00000466861	ATRN	O75882	1429 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SUMO3-205	ENST00000466861	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SUMO3-205	ENST00000466861	RXRB	P28702	533 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	NME9	Q86XW9	330 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	BTG4	Q9NY30	223 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	NFAT5	O94916	1531 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	VPS72	Q15906	364 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SUMO3-205	ENST00000466861	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.2	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.2	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	ABCC6	O95255	1503 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	COG3	Q96JB2	828 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	FYB1	O15117	783 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	CHRNA2	Q15822	529 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	COL18A1	P39060	1754 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SUMO3-205	ENST00000466861	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SUMO3-205	ENST00000466861	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SUMO3-205	ENST00000466861	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SUMO3-205	ENST00000466861	PANK3	Q9H999	370 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SUMO3-205	ENST00000466861	GLI3	P10071	1580 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SUMO3-205	ENST00000466861	LTN1	O94822	1766 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SUMO3-205	ENST00000466861	EVA1C	P58658	441 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SUMO3-205	ENST00000466861	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SUMO3-205	ENST00000466861	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SUMO3-205	ENST00000466861	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SUMO3-205	ENST00000466861	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SUMO3-205	ENST00000466861	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72

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