RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR37O15354 613 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 EVX2Q03828 476 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 NEUROD2Q15784 382 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 C14orf37Q86TY3 774 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 OCEL1Q9H607 264 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 ATF3P18847 181 aa6.65□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.65□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.65□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 TMC2Q8TDI7 906 aa6.65□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 AK7Q96M32 723 aa6.65□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 USP21Q9UK80 565 aa6.65□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.65□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.65□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 C2orf72A6NCS6 295 aa6.64□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 ATRNO75882 1429 aa6.64□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.64□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTS2O95450 1211 aa6.63□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 BRINP3Q76B58 766 aa6.63□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.63□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 PLPP6Q8IY26 295 aa6.63□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.62□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.62□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.62□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.62□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 MBD5Q9P267 1494 aa6.61□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 PTGER2P43116 358 aa6.61□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 C1QTNF8P60827 252 aa6.61□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.6□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 PTCH1Q13635 1447 aa6.6□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.6□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 HAX1O00165 279 aa6.6□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 OXER1Q8TDS5 423 aa6.6□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 DCCP43146 1447 aa6.59□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 EEA1Q15075 1411 aa6.59□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.59□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.59□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM66O15016 1216 aa6.59□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 BAG6P46379 1132 aa6.59□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.59□□□□□ -1.35
ECHDC1-211ENST00000460558 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 ADGRB3O60242 1522 aa6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP350Q5VT06 3117 aa6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 LAMC1P11047 1609 aa6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 GLI3P10071 1580 aa6.57□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 PLCG2P16885 1265 aa6.57□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 OSBPP22059 807 aa6.57□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.57□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 PDE4DQ08499 809 aa6.56□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.56□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 MST1RQ04912 1400 aa6.56□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.56□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.56□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K9P80192 1104 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 PIK3R4Q99570 1358 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.55□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEFA5A3E0 1075 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 G3V3G9 751 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 GABBR2O75899 941 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP2K5Q13163 448 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 TBX22Q9Y458 520 aa6.54□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 TSPY4P0CV99 314 aa6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 TSPY10P0CW01 314 aa6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 IDI1Q13907 227 aa6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 AMHR2Q16671 573 aa6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPM2O94759 1503 aa6.53□□□□□ -1.36
ECHDC1-211ENST00000460558 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.53□□□□□ -1.36
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