RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPT12Q8IYM1 358 aa37.78■■■■□ 3.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTG4Q9NY30 223 aa37.78■■■■□ 3.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa37.78■■■■□ 3.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.77■■■■□ 3.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.77■■■■□ 3.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRAPQ86VF7 1730 aa37.75■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRWD3Q6RI45 1802 aa37.75■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACEP12821 1306 aa37.74■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHG3A1L390 1219 aa37.72■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF8Q3BBV2 869 aa37.72■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.72■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM11Q9NQV5 511 aa37.7■■■■□ 3.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 QRICH2Q9H0J4 1663 aa37.66■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEUROD1Q13562 356 aa37.66■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JS52 829 aa37.65■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYT1Q01538 1121 aa37.65■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUTM2GQ5VZR2 741 aa37.65■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT27Q7Z3Y8 459 aa37.65■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABP2Q9NPB3 220 aa37.64■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0232Q92628 1395 aa37.64■■■■□ 3.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa37.63■■■■□ 3.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa37.61■■■■□ 3.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa37.6■■■■□ 3.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa37.6■■■■□ 3.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABTB2Q8N961 1025 aa37.59■■■■□ 3.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZRANB1Q9UGI0 708 aa37.59■■■■□ 3.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNA2Q15822 529 aa37.58■■■■□ 3.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRKQ7Z2Y5 1582 aa37.51■■■■□ 3.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STRN4Q9NRL3 753 aa37.51■■■■□ 3.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABP1Q9NZU7 370 aa37.51■■■■□ 3.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EVC2Q86UK5 1308 aa37.51■■■■□ 3.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP13Q86W25 1043 aa37.5■■■■□ 3.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP19O94966 1318 aa37.5■■■■□ 3.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB132Q7Z7B7 95 aa37.49■■■■□ 3.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa37.48■■■■□ 3.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa37.47■■■■□ 3.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP6P35125 1406 aa37.45■■■■□ 3.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPDO75976 1380 aa37.45■■■■□ 3.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EVA1CP58658 441 aa37.44■■■■□ 3.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCP02774 474 aa37.42■■■■□ 3.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSH2Q76I76 1423 aa37.41■■■■□ 3.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa37.4■■■■□ 3.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM182BQ5T319 152 aa37.39■■■■□ 3.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa37.38■■■■□ 3.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMO7Q8WWI1 1683 aa37.38■■■■□ 3.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP6P59044 892 aa37.37■■■■□ 3.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP35Q9P2H5 1018 aa37.37■■■■□ 3.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAG6P46379 1132 aa37.36■■■■□ 3.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BARGINQ6ZT62 677 aa37.32■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGPD1P0DJD0 1748 aa37.32■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLIT3O75094 1523 aa37.31■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3C2AO00443 1686 aa37.3■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TONSLQ96HA7 1378 aa37.29■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB7CA1YPR0 619 aa37.29■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARD11Q9BXL7 1154 aa37.29■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCP11L2Q8N4U5 519 aa37.28■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKAP12Q02952 1782 aa37.27■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa37.26■■■■□ 3.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa37.26■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM196AQ6ZSG2 479 aa37.25■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AATKQ6ZMQ8 1374 aa37.24■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE3BQ13370 1112 aa37.23■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC21AQ8NDW8 1320 aa37.21■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRB1P82279 1406 aa37.19■■■■□ 3.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DISP2A7MBM2 1401 aa37.19■■■■□ 3.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM37O94972 964 aa37.17■■■■□ 3.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNH5Q8NCM2 988 aa37.17■■■■□ 3.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL18A1P39060 1754 aa37.14■■■■□ 3.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MON2Q7Z3U7 1717 aa37.13■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX12O15370 315 aa37.12■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF25Q86VW2 580 aa37.12■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa37.11■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AXIN2Q9Y2T1 843 aa37.11■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMC1Q8TDI8 760 aa37.09■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APBA3O96018 575 aa37.08■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR17Q8IZU2 1322 aa37.08■■■■□ 3.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP37.07■■■■□ 3.52
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