RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 ACEP12821 1306 aa30.01■■■□□ 2.4
LTB-211ENST00000446745 EVC2Q86UK5 1308 aa30■■■□□ 2.39
LTB-211ENST00000446745 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.99■■■□□ 2.39
LTB-211ENST00000446745 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.99■■■□□ 2.39
LTB-211ENST00000446745 CABP2Q9NPB3 220 aa29.99■■■□□ 2.39
LTB-211ENST00000446745 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.98■■■□□ 2.39
LTB-211ENST00000446745 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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LTB-211ENST00000446745 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.95■■■□□ 2.39
LTB-211ENST00000446745 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.93■■■□□ 2.38
LTB-211ENST00000446745 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
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LTB-211ENST00000446745 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.91■■■□□ 2.38
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LTB-211ENST00000446745 VPS72Q15906 364 aa29.9■■■□□ 2.38
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LTB-211ENST00000446745 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.84■■■□□ 2.37
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LTB-211ENST00000446745 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.74■■■□□ 2.35
LTB-211ENST00000446745 AKAP12Q02952 1782 aa29.74■■■□□ 2.35
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LTB-211ENST00000446745 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.52■■■□□ 2.32
LTB-211ENST00000446745 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
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LTB-211ENST00000446745 A0A1W2PP64 1363 aa29.5■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 USP31Q70CQ4 1352 aa29.5■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 SOX12O15370 315 aa29.49■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 USP54Q70EL1 1684 aa29.49■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 CRB1P82279 1406 aa29.48■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.48■■■□□ 2.31
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