RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426925.5

SH3BP5-206, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

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Gene SH3BP5, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-206ENST00000426925 ADGRB2O60241 1585 aa20.83■□□□□ 0.92
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SH3BP5-206ENST00000426925 DYNC1I1O14576 645 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP5-206ENST00000426925 IL16Q14005 1332 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP5-206ENST00000426925 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
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SH3BP5-206ENST00000426925 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.77■□□□□ 0.92
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SH3BP5-206ENST00000426925 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
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SH3BP5-206ENST00000426925 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.68■□□□□ 0.9
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SH3BP5-206ENST00000426925 CD109Q6YHK3 1445 aa20.64■□□□□ 0.89
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SH3BP5-206ENST00000426925 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.63■□□□□ 0.89
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SH3BP5-206ENST00000426925 MBD3O95983 291 aa20.63■□□□□ 0.89
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SH3BP5-206ENST00000426925 ST18O60284 1047 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP5-206ENST00000426925 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP5-206ENST00000426925 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP5-206ENST00000426925 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP5-206ENST00000426925 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP5-206ENST00000426925 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP5-206ENST00000426925 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP5-206ENST00000426925 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.59■□□□□ 0.89
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