RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.24■■■□□ 2.11
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TSTA3-201ENST00000425753 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.23■■■□□ 2.11
TSTA3-201ENST00000425753 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
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TSTA3-201ENST00000425753 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-201ENST00000425753 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.18■■■□□ 2.1
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TSTA3-201ENST00000425753 JCADQ9P266 1359 aa28.18■■■□□ 2.1
TSTA3-201ENST00000425753 SHPRHQ149N8 1683 aa28.16■■■□□ 2.1
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TSTA3-201ENST00000425753 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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TSTA3-201ENST00000425753 USP54Q70EL1 1684 aa28.1■■■□□ 2.09
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TSTA3-201ENST00000425753 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.06■■■□□ 2.08
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TSTA3-201ENST00000425753 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.06■■■□□ 2.08
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TSTA3-201ENST00000425753 NLRP13Q86W25 1043 aa28.03■■■□□ 2.08
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TSTA3-201ENST00000425753 NLRP6P59044 892 aa28■■■□□ 2.07
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TSTA3-201ENST00000425753 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
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TSTA3-201ENST00000425753 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
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TSTA3-201ENST00000425753 COL18A1P39060 1754 aa27.75■■■□□ 2.03
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TSTA3-201ENST00000425753 POLKQ9UBT6 870 aa27.71■■■□□ 2.03
TSTA3-201ENST00000425753 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.7■■■□□ 2.03
TSTA3-201ENST00000425753 NGLY1Q96IV0 654 aa27.7■■■□□ 2.02
TSTA3-201ENST00000425753 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
TSTA3-201ENST00000425753 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.69■■■□□ 2.02
TSTA3-201ENST00000425753 PEAK1Q9H792 1746 aa27.69■■■□□ 2.02
TSTA3-201ENST00000425753 FLT4P35916 1363 aa27.69■■■□□ 2.02
TSTA3-201ENST00000425753 NRAPQ86VF7 1730 aa27.68■■■□□ 2.02
TSTA3-201ENST00000425753 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
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