RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.06■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 A0A0G2JS52 829 aa21.04■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 MYT1Q01538 1121 aa21.04■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.04■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.03■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 LRP5O75197 1615 aa21.03■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.03■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.02■□□□□ 0.96
NFE4-201ENST00000420058 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.99■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.99■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.99■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.99■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 DISP2A7MBM2 1401 aa20.98■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 CHRNA2Q15822 529 aa20.98■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 KIAA0232Q92628 1395 aa20.97■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.97■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 STAC3Q96MF2 364 aa20.96■□□□□ 0.95
NFE4-201ENST00000420058 ATP7BP35670 1465 aa20.95■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 TRIM37O94972 964 aa20.93■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.93■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 CDK19Q9BWU1 502 aa20.93■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.92■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 STRN4Q9NRL3 753 aa20.92■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.92■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.91■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 ACEP12821 1306 aa20.9■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.9■□□□□ 0.94
NFE4-201ENST00000420058 BARGINQ6ZT62 677 aa20.89■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.88■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 APBA3O96018 575 aa20.87■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 USP35Q9P2H5 1018 aa20.87■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.86■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 SSH2Q76I76 1423 aa20.86■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 USP19O94966 1318 aa20.84■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.84■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 CPDO75976 1380 aa20.84■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 EVA1CP58658 441 aa20.83■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 ABTB2Q8N961 1025 aa20.83■□□□□ 0.93
NFE4-201ENST00000420058 ITSN1Q15811 1721 aa20.82■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.82■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.82■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 PDE3BQ13370 1112 aa20.81■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.8■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 GCP02774 474 aa20.8■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.79■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.79■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
NFE4-201ENST00000420058 NLRP13Q86W25 1043 aa20.76■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 CABP2Q9NPB3 220 aa20.76■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 RREB1Q92766 1687 aa20.74■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.73■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 NBPF14Q5TI25 921 aa20.72■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.72■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 CABP1Q9NZU7 370 aa20.72■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.72■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.71■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
NFE4-201ENST00000420058 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 CRB1P82279 1406 aa20.7■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.69■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.69■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 PLSCR1O15162 318 aa20.68■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 NLRP6P59044 892 aa20.68■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 PROM2Q8N271 834 aa20.68■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 PEAK1Q9H792 1746 aa20.67■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 KCNQ2O43526 872 aa20.67■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 SPON1Q9HCB6 807 aa20.67■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 USP6P35125 1406 aa20.67■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 UTRNP46939 3433 aa20.66■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 SLIT3O75094 1523 aa20.64■□□□□ 0.9
NFE4-201ENST00000420058 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.64■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 COL18A1P39060 1754 aa20.64■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.63■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.63■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.63■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 DDB1Q16531 1140 aa20.63■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 YY1P25490 414 aa20.62■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.62■□□□□ 0.89
NFE4-201ENST00000420058 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms