RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 EVC2Q86UK5 1308 aa27.95■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 SLIT2O94813 1529 aa27.95■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.93■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 FAM83GA6ND36 823 aa27.92■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKRD54-204ENST00000411961 ABTB2Q8N961 1025 aa27.88■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 CABP1Q9NZU7 370 aa27.88■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 VPS72Q15906 364 aa27.86■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 BTG4Q9NY30 223 aa27.86■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.85■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.85■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.85■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.83■■■□□ 2.05
ANKRD54-204ENST00000411961 GLI3P10071 1580 aa27.81■■■□□ 2.04
ANKRD54-204ENST00000411961 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
ANKRD54-204ENST00000411961 NLRP13Q86W25 1043 aa27.8■■■□□ 2.04
ANKRD54-204ENST00000411961 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
ANKRD54-204ENST00000411961 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.79■■■□□ 2.04
ANKRD54-204ENST00000411961 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
ANKRD54-204ENST00000411961 KIAA0232Q92628 1395 aa27.78■■■□□ 2.04
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
ANKRD54-204ENST00000411961 A0A0G2JS52 829 aa27.76■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 MYT1Q01538 1121 aa27.76■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 CHRNA2Q15822 529 aa27.76■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 USP6P35125 1406 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 NRAPQ86VF7 1730 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.73■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 NLRP6P59044 892 aa27.73■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 EVA1CP58658 441 aa27.71■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 STRN4Q9NRL3 753 aa27.71■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 USP19O94966 1318 aa27.7■■■□□ 2.03
ANKRD54-204ENST00000411961 GCP02774 474 aa27.7■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.69■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 CCDC125Q86Z20 511 aa27.68■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 TMC1Q8TDI8 760 aa27.68■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.68■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 AKAP12Q02952 1782 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.66■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.66■■■□□ 2.02
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ANKRD54-204ENST00000411961 SLC24A1O60721 1099 aa27.65■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.64■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 SSH2Q76I76 1423 aa27.64■■■□□ 2.02
ANKRD54-204ENST00000411961 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.64■■■□□ 2.01
ANKRD54-204ENST00000411961 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.64■■■□□ 2.01
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ANKRD54-204ENST00000411961 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ANKRD54-204ENST00000411961 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.62■■■□□ 2.01
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ANKRD54-204ENST00000411961 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.61■■■□□ 2.01
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ANKRD54-204ENST00000411961 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.59■■■□□ 2.01
ANKRD54-204ENST00000411961 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.59■■■□□ 2.01
ANKRD54-204ENST00000411961 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.59■■■□□ 2.01
ANKRD54-204ENST00000411961 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
ANKRD54-204ENST00000411961 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.58■■■□□ 2.01
ANKRD54-204ENST00000411961 SLIT3O75094 1523 aa27.57■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 SOX12O15370 315 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 TESK2Q96S53 571 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.55■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 USP47Q96K76 1375 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-204ENST00000411961 TMF1P82094 1093 aa27.51■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.51■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 BARGINQ6ZT62 677 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 FAM182BQ5T319 152 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 NME9Q86XW9 330 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
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ANKRD54-204ENST00000411961 A0A1W2PP64 1363 aa27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-204ENST00000411961 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.46■■□□□ 1.99
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