RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397070.6

TM2D2-201, Transcript of TM2 domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D2, Length 1,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2-201ENST00000397070 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.1■■□□□ 1.45
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TM2D2-201ENST00000397070 APAF1O14727 1248 aa24.08■■□□□ 1.45
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TM2D2-201ENST00000397070 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.08■■□□□ 1.45
TM2D2-201ENST00000397070 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.07■■□□□ 1.44
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TM2D2-201ENST00000397070 OVOS2Q6IE36 1432 aa24■■□□□ 1.43
TM2D2-201ENST00000397070 SSH2Q76I76 1423 aa24■■□□□ 1.43
TM2D2-201ENST00000397070 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
TM2D2-201ENST00000397070 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
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TM2D2-201ENST00000397070 CCDC27Q2M243 656 aa23.97■■□□□ 1.43
TM2D2-201ENST00000397070 POLKQ9UBT6 870 aa23.97■■□□□ 1.43
TM2D2-201ENST00000397070 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.96■■□□□ 1.43
TM2D2-201ENST00000397070 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.96■■□□□ 1.43
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TM2D2-201ENST00000397070 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
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TM2D2-201ENST00000397070 WDR63Q8IWG1 891 aa23.91■■□□□ 1.42
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TM2D2-201ENST00000397070 LTN1O94822 1766 aa23.83■■□□□ 1.41
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TM2D2-201ENST00000397070 NEUROD2Q15784 382 aa23.83■■□□□ 1.41
TM2D2-201ENST00000397070 IL13P35225 146 aa23.82■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.81■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.81■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 NEFMP07197 916 aa23.8■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 IL16Q14005 1332 aa23.78■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.78■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.77■■□□□ 1.4
TM2D2-201ENST00000397070 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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TM2D2-201ENST00000397070 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
TM2D2-201ENST00000397070 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.7■■□□□ 1.39
TM2D2-201ENST00000397070 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.7■■□□□ 1.38
TM2D2-201ENST00000397070 HMOX1P09601 288 aa23.7■■□□□ 1.38
TM2D2-201ENST00000397070 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
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TM2D2-201ENST00000397070 ARHGEF10O15013 1369 aa23.69■■□□□ 1.38
TM2D2-201ENST00000397070 C14orf37Q86TY3 774 aa23.69■■□□□ 1.38
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