RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
GKAP1-202ENST00000376365 SHPRHQ149N8 1683 aa35.8■■■■□ 3.32
GKAP1-202ENST00000376365 A0A1W2PP64 1363 aa35.79■■■■□ 3.32
GKAP1-202ENST00000376365 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.79■■■■□ 3.32
GKAP1-202ENST00000376365 CCDC7Q96M83 1385 aa35.77■■■■□ 3.32
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF10O15013 1369 aa35.76■■■■□ 3.31
GKAP1-202ENST00000376365 ALS2Q96Q42 1657 aa35.75■■■■□ 3.31
GKAP1-202ENST00000376365 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.75■■■■□ 3.31
GKAP1-202ENST00000376365 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.74■■■■□ 3.31
GKAP1-202ENST00000376365 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.73■■■■□ 3.31
GKAP1-202ENST00000376365 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
GKAP1-202ENST00000376365 SSH2Q76I76 1423 aa35.7■■■■□ 3.31
GKAP1-202ENST00000376365 ABTB2Q8N961 1025 aa35.7■■■■□ 3.31
GKAP1-202ENST00000376365 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.7■■■■□ 3.3
GKAP1-202ENST00000376365 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
GKAP1-202ENST00000376365 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.69■■■■□ 3.3
GKAP1-202ENST00000376365 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.3
GKAP1-202ENST00000376365 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.67■■■■□ 3.3
GKAP1-202ENST00000376365 PLEKHG5O94827 1062 aa35.65■■■■□ 3.3
GKAP1-202ENST00000376365 PANK3Q9H999 370 aa35.64■■■■□ 3.3
GKAP1-202ENST00000376365 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.63■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 PIK3C2AO00443 1686 aa35.63■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.61■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 NLRP6P59044 892 aa35.6■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 NLRP13Q86W25 1043 aa35.6■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.59■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
GKAP1-202ENST00000376365 NME9Q86XW9 330 aa35.57■■■■□ 3.28
GKAP1-202ENST00000376365 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.57■■■■□ 3.28
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA3Q99758 1704 aa35.56■■■■□ 3.28
GKAP1-202ENST00000376365 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.55■■■■□ 3.28
GKAP1-202ENST00000376365 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.53■■■■□ 3.28
GKAP1-202ENST00000376365 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
GKAP1-202ENST00000376365 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.51■■■■□ 3.28
GKAP1-202ENST00000376365 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 LRP6O75581 1613 aa35.5■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.5■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 USP19O94966 1318 aa35.5■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 USP31Q70CQ4 1352 aa35.49■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 ADAMTS2O95450 1211 aa35.49■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 USP54Q70EL1 1684 aa35.49■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.48■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 FYB1O15117 783 aa35.47■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 COG3Q96JB2 828 aa35.47■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.45■■■■□ 3.27
GKAP1-202ENST00000376365 SLIT3O75094 1523 aa35.44■■■■□ 3.26
GKAP1-202ENST00000376365 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.43■■■■□ 3.26
GKAP1-202ENST00000376365 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.43■■■■□ 3.26
GKAP1-202ENST00000376365 GCP02774 474 aa35.42■■■■□ 3.26
GKAP1-202ENST00000376365 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.42■■■■□ 3.26
GKAP1-202ENST00000376365 SOX12O15370 315 aa35.41■■■■□ 3.26
GKAP1-202ENST00000376365 C8orf37Q96NL8 207 aa35.38■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.38■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 NSD2O96028 1365 aa35.37■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 NGLY1Q96IV0 654 aa35.35■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.35■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA0232Q92628 1395 aa35.34■■■■□ 3.25
GKAP1-202ENST00000376365 NFAT5O94916 1531 aa35.32■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.32■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 CPDO75976 1380 aa35.31■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 FAM83GA6ND36 823 aa35.28■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 LTN1O94822 1766 aa35.28■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.27■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 CHRNA2Q15822 529 aa35.27■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 MORC1Q86VD1 984 aa35.27■■■■□ 3.24
GKAP1-202ENST00000376365 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 AFF2P51816 1311 aa35.25■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.24■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.24■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.23■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 BTG4Q9NY30 223 aa35.2■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 USP21Q9UK80 565 aa35.2■■■■□ 3.23
GKAP1-202ENST00000376365 SLIT2O94813 1529 aa35.19■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 FBLN1P23142 703 aa35.19■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.19■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.17■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.16■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 COL18A1P39060 1754 aa35.16■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 AMPHP49418 695 aa35.15■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC6O95255 1503 aa35.15■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
GKAP1-202ENST00000376365 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms