RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 MSH5O43196 834 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD4-201ENST00000356924 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
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ABCD4-201ENST00000356924 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 ACEP12821 1306 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 NME9Q86XW9 330 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 USP6P35125 1406 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 SSH2Q76I76 1423 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.74□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.73□□□□□ -0.05
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ABCD4-201ENST00000356924 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 CFAP53Q96M91 514 aa14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 NUDCQ9Y266 331 aa14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-201ENST00000356924 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.72□□□□□ -0.05
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ABCD4-201ENST00000356924 HSPA2P54652 639 aa14.71□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 FBLN1P23142 703 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 POLKQ9UBT6 870 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 STRCQ7RTU9 1775 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 PDE3BQ13370 1112 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF521Q96K83 1311 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 COG3Q96JB2 828 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 PIK3C2AO00443 1686 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 APAF1O14727 1248 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 USP54Q70EL1 1684 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 RUNDC1Q96C34 613 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 USP31Q70CQ4 1352 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-201ENST00000356924 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 NBR1Q14596 966 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 PEAK1Q9H792 1746 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 C14orf37Q86TY3 774 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 NGEFQ8N5V2 710 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 TMEM94Q12767 1356 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 IL13P35225 146 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 GOLGA2Q08379 1002 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.58□□□□□ -0.07
ABCD4-201ENST00000356924 SLFN5Q08AF3 891 aa14.58□□□□□ -0.07
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ABCD4-201ENST00000356924 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.58□□□□□ -0.07
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ABCD4-201ENST00000356924 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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ABCD4-201ENST00000356924 CCDC27Q2M243 656 aa14.56□□□□□ -0.08
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ABCD4-201ENST00000356924 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-201ENST00000356924 FCHSD2O94868 740 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-201ENST00000356924 NLRP6P59044 892 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-201ENST00000356924 NEUROD2Q15784 382 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-201ENST00000356924 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-201ENST00000356924 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-201ENST00000356924 ABTB2Q8N961 1025 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCD4-201ENST00000356924 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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