RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP53Q96M91 514 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF521Q96K83 1311 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 APAF1O14727 1248 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-204ENST00000352260 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 PTCH1Q13635 1447 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA2Q08379 1002 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 NGEFQ8N5V2 710 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 AKAP12Q02952 1782 aa24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 MS4A1P11836 297 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 RUNDC1Q96C34 613 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-204ENST00000352260 ITSN1Q15811 1721 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 SLFN5Q08AF3 891 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 PIK3R4Q99570 1358 aa24.23■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 NME9Q86XW9 330 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 NUTM2FA1L443 756 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 WWC1Q8IX03 1113 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 KCNA6P17658 529 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 POLKQ9UBT6 870 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 E9PSI1 815 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 ACEP12821 1306 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 FBLN1P23142 703 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.14■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 COG3Q96JB2 828 aa24.14■■□□□ 1.46
SPNS1-204ENST00000352260 USP6P35125 1406 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 NEFMP07197 916 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 NEUROD2Q15784 382 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 IL27Q8NEV9 243 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 BACH2Q9BYV9 841 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC27Q2M243 656 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 PDE4AP27815 886 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 PLIN1O60240 522 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 SSH2Q76I76 1423 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 WDR63Q8IWG1 891 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-204ENST00000352260 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 IL13P35225 146 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 FCHSD2O94868 740 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-204ENST00000352260 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 CERKQ8TCT0 537 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 USP31Q70CQ4 1352 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-204ENST00000352260 CRBNQ96SW2 442 aa23.99■■□□□ 1.43
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