RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340305.9

TMEM201-201, Transcript of transmembrane protein 201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM201, Length 3,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201-201ENST00000340305 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.14■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 ATP10AO60312 1499 aa17.14■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 CCDC173Q0VFZ6 552 aa17.13■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 ZSCAN30Q86W11 494 aa17.13■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 MAST1Q9Y2H9 1570 aa17.13■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 NOS1P29475 1434 aa17.13■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 MADDQ8WXG6 1647 aa17.12■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 TSPYL6Q8N831 410 aa17.12■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.12■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 KIF2CQ99661 725 aa17.12■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 AK9Q5TCS8 1911 aa17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 PRKAR2BP31323 418 aa17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 SLC24A1O60721 1099 aa17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 TPM2P07951 284 aa17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 SNX21Q969T3 373 aa17.11■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 PTPRTO14522 1441 aa17.1■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 KIF16BQ96L93 1317 aa17.1■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 RBSNQ9H1K0 784 aa17.1■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 PLCB2Q00722 1185 aa17.09■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 LAMC1P11047 1609 aa17.09■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 59
TMEM201-201ENST00000340305 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 UNC13BO14795 1591 aa17.09■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 SYCE3A1L190 88 aa17.08■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 CCDC27Q2M243 656 aa17.08■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 BMP2KLQ5H9B9 411 aa17.08■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 IQGAP3Q86VI3 1631 aa17.08■□□□□ 0.33
TMEM201-201ENST00000340305 EVC2Q86UK5 1308 aa17.08■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 CDC45O75419 566 aa17.08■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa17.08■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 PREX2Q70Z35 1606 aa17.08■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 UQCRHLA0A096LP55 91 aa17.07■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 UQCRHP07919 91 aa17.07■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 DCTN1Q14203 1278 aa17.07■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 IQGAP1P46940 1657 aa17.06■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 MYOM1P52179 1685 aa17.06■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 DDIT3P35638 169 aa17.06■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 CLTCL1P53675 1640 aa17.05■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 KLHL40Q2TBA0 621 aa17.05■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 DTNBO60941 627 aa17.05■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 PDCL3Q9H2J4 239 aa17.05■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 STAC3Q96MF2 364 aa17.04■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 TSHZ3Q63HK5 1081 aa17.04■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 TSC1Q92574 1164 aa17.04■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.04■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 GDPD2Q9HCC8 539 aa17.04■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 FAM83GA6ND36 823 aa17.03■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 FAM177BA6PVY3 158 aa17.03■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 SOX12O15370 315 aa17.03■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 SIRT2Q8IXJ6 389 aa17.03■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 OFD1O75665 1012 aa17.03■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 CD109Q6YHK3 1445 aa17.03■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.02■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.02■□□□□ 0.32
TMEM201-201ENST00000340305 KRT24Q2M2I5 525 aa17.01■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 PTMSP20962 102 aa17.01■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 GCC1Q96CN9 775 aa17.01■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 CEP152O94986 1710 aa17.01■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 FYB1O15117 783 aa17■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 SLC4A10Q6U841 1118 aa17■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 NUCB2P80303 420 aa16.99■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 PPP1R9BQ96SB3 815 aa16.99■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.99■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 PLCH2O75038 1416 aa16.99■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 RABEP1Q15276 862 aa16.99■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 NEK4P51957 841 aa16.98■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.98■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 GPT2Q8TD30 523 aa16.98■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 CABP1Q9NZU7 370 aa16.98■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 PLXNC1O60486 1568 aa16.98■□□□□ 0.31
TMEM201-201ENST00000340305 ST18O60284 1047 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms