RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 KDM6BO15054 1643 aa18.8■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.8■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.79■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 WDR63Q8IWG1 891 aa18.79■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 PZPP20742 1482 aa18.79■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.79■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.78■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 TSPY26PQ9H489 355 aa18.78■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.78■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 HSP90B2PQ58FF3 399 aa18.77■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.77■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.77■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 CDC45O75419 566 aa18.77■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 NEK4P51957 841 aa18.77■□□□□ 0.6
KCNS1-201ENST00000306117 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 COG3Q96JB2 828 aa18.76■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 AAMPQ13685 434 aa18.76■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM27P14373 513 aa18.76■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 FBLN1P23142 703 aa18.76■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC27Q2M243 656 aa18.76■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.76■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 PRAM1Q96QH2 718 aa18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 TOMM22Q9NS69 142 aa18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 TPM1P09493 284 aa18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 STAC3Q96MF2 364 aa18.75■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.74■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CBX1P83916 185 aa18.74■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 FIBPO43427 364 aa18.74■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 GNAI1P63096 354 aa18.73■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CABP1Q9NZU7 370 aa18.73■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.73■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.73■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 SKIDA1Q1XH10 827 aa18.73■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC70Q6NSX1 233 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 AMPHP49418 695 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 FOSBP53539 338 aa18.72■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 ERICH4A6NGS2 130 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 IFT140Q96RY7 1462 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.71■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
KCNS1-201ENST00000306117 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 DCTN1Q14203 1278 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF428Q96B54 188 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 H0YHG0 523 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 SSFA2P28290 1259 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.7■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 SDF4Q9BRK5 362 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 RABEP1Q15276 862 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.69■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 GRIN2AQ12879 1464 aa18.68■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.67■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 ACBD3Q9H3P7 528 aa18.66■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 GCC1Q96CN9 775 aa18.65■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.64■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
KCNS1-201ENST00000306117 PDILTQ8N807 584 aa18.64■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.64■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 CPLX1O14810 134 aa18.64■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.63■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 SYCE3A1L190 88 aa18.63■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.63■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 RUFY1Q96T51 708 aa18.63■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.63■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.63■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
KCNS1-201ENST00000306117 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms