RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa33.96■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 NRKQ7Z2Y5 1582 aa33.95■■■■□ 3.03
PQLC3-201ENST00000295083 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
PQLC3-201ENST00000295083 KNSTRNQ9Y448 316 aa33.93■■■■□ 3.02
PQLC3-201ENST00000295083 PHLPP1O60346 1717 aa33.9■■■■□ 3.02
PQLC3-201ENST00000295083 NME9Q86XW9 330 aa33.9■■■■□ 3.02
PQLC3-201ENST00000295083 SBNO1A3KN83 1393 aa33.89■■■■□ 3.02
PQLC3-201ENST00000295083 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
PQLC3-201ENST00000295083 FYB1O15117 783 aa33.88■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 ZRANB1Q9UGI0 708 aa33.88■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.88■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.87■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 ABTB2Q8N961 1025 aa33.87■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 NUTM2GQ5VZR2 741 aa33.86■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 TTC21AQ8NDW8 1320 aa33.86■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 CGNL1Q0VF96 1302 aa33.86■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 HSPA1LP34931 641 aa33.85■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.84■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 PIK3C2AO00443 1686 aa33.84■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 FBXO41Q8TF61 875 aa33.83■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 GGNBP2Q9H3C7 697 aa33.83■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 ALS2Q96Q42 1657 aa33.83■■■■□ 3.01
PQLC3-201ENST00000295083 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PQLC3-201ENST00000295083 NLRP6P59044 892 aa33.79■■■■□ 3
PQLC3-201ENST00000295083 PLEKHG5O94827 1062 aa33.79■■■■□ 3
PQLC3-201ENST00000295083 KIF20BQ96Q89 1820 aa33.78■■■■□ 3
PQLC3-201ENST00000295083 ARHGEF10O15013 1369 aa33.75■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 USP31Q70CQ4 1352 aa33.74■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa33.73■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 NLRP13Q86W25 1043 aa33.73■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.73■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa33.72■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.72■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 COG3Q96JB2 828 aa33.72■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.71■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 NSD2O96028 1365 aa33.71■■■□□ 2.99
PQLC3-201ENST00000295083 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 FBLN1P23142 703 aa33.67■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 USP19O94966 1318 aa33.67■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 MORC1Q86VD1 984 aa33.67■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa33.66■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 USP54Q70EL1 1684 aa33.66■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 SOX12O15370 315 aa33.66■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 JCADQ9P266 1359 aa33.65■■■□□ 2.98
PQLC3-201ENST00000295083 GCP02774 474 aa33.63■■■□□ 2.97
PQLC3-201ENST00000295083 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
PQLC3-201ENST00000295083 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.62■■■□□ 2.97
PQLC3-201ENST00000295083 SHPRHQ149N8 1683 aa33.61■■■□□ 2.97
PQLC3-201ENST00000295083 SLIT3O75094 1523 aa33.6■■■□□ 2.97
PQLC3-201ENST00000295083 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
PQLC3-201ENST00000295083 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.59■■■□□ 2.97
PQLC3-201ENST00000295083 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
PQLC3-201ENST00000295083 ABCA3Q99758 1704 aa33.56■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 KCNH5Q8NCM2 988 aa33.56■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 NFAT5O94916 1531 aa33.55■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 ANP32CO43423 234 aa33.53■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 RALBP1Q15311 655 aa33.53■■■□□ 2.96
PQLC3-201ENST00000295083 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.5■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 POLKQ9UBT6 870 aa33.49■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.49■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 PPP2R1AP30153 589 aa33.49■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa33.49■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 MAP3K19Q56UN5 1328 aa33.48■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.48■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 KIAA0232Q92628 1395 aa33.47■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.47■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 ADAMTS2O95450 1211 aa33.47■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
PQLC3-201ENST00000295083 LTN1O94822 1766 aa33.44■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 LRP6O75581 1613 aa33.44■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 MTHFSP49914 203 aa33.44■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 CHRNA2Q15822 529 aa33.44■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 CPDO75976 1380 aa33.43■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 PRDM11Q9NQV5 511 aa33.42■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 FAM83GA6ND36 823 aa33.41■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 PEAK1Q9H792 1746 aa33.39■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 AMPHP49418 695 aa33.39■■■□□ 2.94
PQLC3-201ENST00000295083 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.38■■■□□ 2.93
PQLC3-201ENST00000295083 MIER1Q8N108 512 aa33.37■■■□□ 2.93
PQLC3-201ENST00000295083 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
PQLC3-201ENST00000295083 HOXC9P31274 260 aa33.35■■■□□ 2.93
PQLC3-201ENST00000295083 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa33.35■■■□□ 2.93
PQLC3-201ENST00000295083 IP6K1Q92551 441 aa33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms