RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 ESPNB1AK53 854 aa31.23■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.23■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 MTHFSP49914 203 aa31.23■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 WWC1Q8IX03 1113 aa31.23■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31.23■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 E9PSI1 815 aa31.22■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 ADGRB1O14514 1584 aa31.21■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa31.21■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa31.2■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 TBC1D32Q96NH3 1257 aa31.2■■■□□ 2.59
PKDCC-201ENST00000294964 TRAK2O60296 914 aa31.2■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 MYH16Q9H6N6 1097 aa31.18■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.17■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.16■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 TCP11L2Q8N4U5 519 aa31.16■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 PANK1Q8TE04 598 aa31.16■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 GRPEL1Q9HAV7 217 aa31.16■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 ZFYVE9O95405 1425 aa31.15■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 BCL2L13Q9BXK5 485 aa31.14■■■□□ 2.58
PKDCC-201ENST00000294964 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.13■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 COG6Q9Y2V7 657 aa31.13■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 TNNQ9UQP3 1299 aa31.11■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 CGNL1Q0VF96 1302 aa31.11■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 TPM2P07951 284 aa31.1■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 CLUAP1Q96AJ1 413 aa31.1■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 EVC2Q86UK5 1308 aa31.1■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 RUNDC1Q96C34 613 aa31.09■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.09■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 PDCL3Q9H2J4 239 aa31.09■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 SHPRHQ149N8 1683 aa31.08■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 CHMP5Q9NZZ3 219 aa31.07■■■□□ 2.57
PKDCC-201ENST00000294964 PODXL2Q9NZ53 605 aa31.07■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 GGNBP2Q9H3C7 697 aa31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 TULP4Q9NRJ4 1543 aa31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 SLIT1O75093 1534 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 PDE3AQ14432 1141 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-201ENST00000294964 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP53Q96M91 514 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 PRAM1Q96QH2 718 aa30.99■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 LTKP29376 864 aa30.98■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.98■■■□□ 2.55
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PKDCC-201ENST00000294964 DDX11L8A8MPP1 907 aa30.97■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PP64 1363 aa30.96■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa30.96■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 ALKQ9UM73 1620 aa30.95■■■□□ 2.55
PKDCC-201ENST00000294964 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 GAS2L3Q86XJ1 694 aa30.94■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 FBLN1P23142 703 aa30.94■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.94■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.93■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 NGEFQ8N5V2 710 aa30.92■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHG5O94827 1062 aa30.92■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.92■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.92■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.91■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.9■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
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PKDCC-201ENST00000294964 C22orf23Q9BZE7 217 aa30.89■■■□□ 2.54
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.87■■■□□ 2.53
PKDCC-201ENST00000294964 EID1Q9Y6B2 187 aa30.87■■■□□ 2.53
PKDCC-201ENST00000294964 FYB1O15117 783 aa30.87■■■□□ 2.53
PKDCC-201ENST00000294964 WDR63Q8IWG1 891 aa30.87■■■□□ 2.53
PKDCC-201ENST00000294964 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.84■■■□□ 2.53
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PKDCC-201ENST00000294964 CABP1Q9NZU7 370 aa30.84■■■□□ 2.53
PKDCC-201ENST00000294964 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
PKDCC-201ENST00000294964 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
PKDCC-201ENST00000294964 CDK19Q9BWU1 502 aa30.83■■■□□ 2.53
PKDCC-201ENST00000294964 USP32Q8NFA0 1604 aa30.82■■■□□ 2.52
PKDCC-201ENST00000294964 RBM10P98175 930 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PKDCC-201ENST00000294964 HSCBQ8IWL3 235 aa30.81■■■□□ 2.52
PKDCC-201ENST00000294964 RIPK4P57078 832 aa30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-201ENST00000294964 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PKDCC-201ENST00000294964 ABCC11Q96J66 1382 aa30.8■■■□□ 2.52
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