RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PXDNQ92626 1479 aa27.72■■■□□ 2.03
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.52■■■□□ 2
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHPRHQ149N8 1683 aa27.36■■□□□ 1.97
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
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