RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063396.9

Sphk1-201, Transcript of Sphingosine kinase 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene Sphk1, Length 2,659 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Tpm2P58774 284 aa20.56■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Stk24Q99KH8 431 aa20.56■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 CastP51125 788 aa20.55■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Tsen2Q6P7W5 460 aa20.55■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 AatkQ80YE4 1365 aa20.55■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Efcab6Q6P1E8 1516 aa20.54■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Uggt1Q6P5E4 1551 aa20.54■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Fndc1E9Q043 1732 aa20.54■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa20.53■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ino80Q6ZPV2 1559 aa20.53■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Sphk1-201ENSMUST00000063396 FanciQ8K368 1330 aa20.52■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 InsrP15208 1372 aa20.51■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Trpm1Q2TV84 1622 aa20.5■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa20.49■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Kif3bQ61771 747 aa20.49■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Znf330Q922H9 316 aa20.49■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Abca6Q8K441 1624 aa20.48■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Tmx3Q8BXZ1 456 aa20.48■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 MaddQ80U28 1577 aa20.48■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Aplp1Q03157 653 aa20.48■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa20.48■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa20.48■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ankrd50F7BE84 1390 aa20.47■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ccdc60Q8C4J0 545 aa20.47■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa20.46■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa20.46■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Wwc1Q5SXA9 1104 aa20.46■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ripk4Q9ERK0 786 aa20.46■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Kiaa0556Q8C753 1610 aa20.46■□□□□ 0.87
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Fgd6Q69ZL1 1399 aa20.45■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Wdr63B2RY71 923 aa20.45■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa20.44■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Atp10dQ8K2X1 1416 aa20.44■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Skint5A7XUY5 1461 aa20.44■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa20.44■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Erbb4Q61527 1308 aa20.44■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Bag4Q8CI61 457 aa20.43■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ciz1Q8VEH2 845 aa20.43■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Naip7Q9JIB3 1402 aa20.43■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Nos1Q9Z0J4 1429 aa20.43■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Bloc1s4Q8VED2 215 aa20.43■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Stag3O70576 1240 aa20.42■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Cetn4Q8K4K1 168 aa20.42■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa20.42■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa20.42■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 LifrP42703 1092 aa20.41■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Pdcl2Q78Y63 240 aa20.41■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 PalldQ9ET54 1408 aa20.41■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Nutm1Q8BHP2 1126 aa20.41■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Pik3r4Q8VD65 1358 aa20.41■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Nrxn1Q9CS84 1514 aa20.4■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ift172Q6VH22 1749 aa20.4■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Cavin4A2AMM0 362 aa20.4■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa20.4■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Casq1O09165 405 aa20.4■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 VgfQ0VGU4 617 aa20.4■□□□□ 0.86
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Irf5P56477 497 aa20.39■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 GorabQ8BRM2 368 aa20.39■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Nek4Q9Z1J2 792 aa20.38■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Znf541Q0GGX2 1363 aa20.38■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 EngaseQ8BX80 734 aa20.38■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 PaskQ8CEE6 1383 aa20.37■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Gse1Q3U3C9 1213 aa20.37■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa20.37■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Mknk2Q8CDB0 459 aa20.37■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Cfap65Q3V0B4 1847 aa20.35■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa20.35■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Prex1Q69ZK0 1650 aa20.35■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Fez1Q8K0X8 392 aa20.35■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Erich6bQ9D4S6 220 aa20.35■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 MvpQ9EQK5 861 aa20.35■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 ImpactO55091 318 aa20.34■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Q3UPC7 1272 aa20.34■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Lrrc7Q80TE7 1490 aa20.34■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 AU022751B1B0V2 589 aa20.34■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Vsig10D3YX43 558 aa20.34■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ush1cQ9ES64 910 aa20.34■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 CenpjQ569L8 1344 aa20.34■□□□□ 0.85
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Rasa1E9PYG6 1038 aa20.33■□□□□ 0.84
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Nectin2P32507 530 aa20.33■□□□□ 0.84
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa20.33■□□□□ 0.84
Sphk1-201ENSMUST00000063396 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Nsd3Q6P2L6 1439 aa20.32■□□□□ 0.84
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Ankrd44B2RXR6 993 aa20.32■□□□□ 0.84
Sphk1-201ENSMUST00000063396 Mdc1Q5PSV9 1707 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 154.1 ms